长期以来，我国能源工业一直存在结构扭曲。我国能源工业结构扭曲，产生了大量的问题。通过经济学分析，探寻我国能源工业结构优化路径选择，有助于认清我国能源工业结构存在的问题，为政府部门决策提供科学依据。　　 笔者认为，尽管能源工业的不同部门由于其行业特征、市场特点和国家化程度不同，其优化途径和相应政策也存在种种差异，但实际上都是为了一个目的，即提高能源部门竞争效率、发挥市场配置资源的基础性作用、实现市场有效竞争。因此本文将结构优化建立在提高效率的视角上，并给出了本文的效率定义，即提高市场竞争效率、资源配置效率和经济社会效益。市场竞争机制决定着市场结构，市场结构又进一步决定企业行为并进而影响市场运行效率与绩效。因此本文理论部分首先回顾了有关市场垄断与竞争的理论，在此基础上沿着效率的主线，回顾了一个部门内部的资金来源结构、投资主体结构、股权结构理论和部门与部门之间的横向关联、纵向关联理论，构成一个优化的理论分析体系。　　 能源工业过去的体制变迁造就了今天的能源工业结构，而能源工业市场化改革的目标与方向又决定着能源工业结构优化的目标与方向。本文通过回顾世界各国能源工业市场化改革经验教训、我国能源工业宏观管理体制改革历程和投资体制历程及其绩效，结合已有研究成果，提出我国市场化改革总体目标即要提高能源部门与能源企业的市场效率与国际竞争力，促进能源产业协调发展，为社会消费者提供充足、高效、清洁、环保、稳定和低成本的能源产品，这个目标也为资金来源结构、投资主体结构优化以及在部门关联前提下部门协调优化发展指明了方向。能源工业市场化的推进，关键在打破垄断，目的在于增强竞争、提高效率，形成有效竞争的市场格局。资金来源结构优化、投资主体结构优化作为能源工业市场化改革的一部分，出发点也在于促进市场竞争、提高市场效率。　　 本文从市场集中度、企业规模、资金来源、投资主体、股权结构等角度分析了我国能源工业不同部门资金来源与投资主体结构的现状，发现我国能源工业各个部门资金来源结构与投资主体结构存在共性问题，即资金来源渠道单一、投资主体单一、股权过于集中、国有股-股独大问题突出、能源工业企业国际竞争力依然不高，本文指出产生这种现象的根源在于体制改革的历史原因和市场现状的特点不同。通过建立在博弈论分析模型基础上的经济学分析，本章分别论述了石油工业应引入有限竞争、电力工业应引入有限竞争及煤炭工业需要加大市场重组整合、提高企业规模与市场控制力的观点，并利用灰色关联度模型分析了不同的资金来源渠道与投资主体对能源工业发展的影响力，为资金来源结构优化与投资主体结构优化提供实证支持。　　 研究工业结构优化问题，就必须从系统角度出发，考虑到产业与产业之间、部门与部门之间、企业与企业之间的关联问题。本文从产业关联的角度出发，通过横向关联与纵向关联分析，研究能源工业结构中部门结构优化问题。在横向关联分析中，本文通过实证证明了我国一次能源产品之间的确存在横向替代关系，并通过经济学模型分析了价格变动给替代性产品所造成的影响，指出如果某种能源产品价格发生变动，与其具有替代性的能源产品价格也将随之同向波动。笔者接着研究了我国常规能源边际成本曲线，发现常规能源边际成本已经进入上升阶段，而与之相对比的是可再生能源数据在大幅下降，可再生能源生产效率在不断提高，进而通过经济学模型说明了可再生能源将越来越具有竞争力。在纵向关联关系的论述中，本文选取了具有重要的现实意义和理论意义的煤电为突破点，研究了煤电问题的起因、实质及解决的思路，指出解决煤电矛盾的关键是要意识到煤炭与电力之间的关系实际上是一条产业链上的上下游产业关系，解决它们的矛盾也必须从整个产业链的角度考虑问题。在此思路基础上，本文研究了煤电联动及纵向一体化带来的经济效益情况，指出纵向一体化的产出和利润均大于纵向一体化之前。