在经济全球化的背景下，自由贸易区合作在世界各地蓬勃发展，中国—东盟自由贸易区则是其中之一。中国—东盟自由贸易区初步建设以来，双方大幅度降低或取消关税和非关税壁垒，使双边贸易流量大幅度上升，给双方的经济发展带来了推进作用。随着中国与东盟经济发展，双方签署自由贸易区的旧协定已经不能满足当前双边经济发展的需求，经过多次谈判，双方于2015年11月21日在马来西亚吉隆玻正式签署中国—东盟自由贸易区升级版《议定书》，主要丰富、补充与完善原有协议，提升了该自由贸易协定的标准。然而，贸易自由化的提升也是一把双刃剑，中国与东盟各国绝大多数属于发展中国家，资源和生产的产品相似性较高，导致区域内成员国竞争激烈，部分成员国内各产业受到自由贸易的冲击，加上受到区外的不利影响，为中国—东盟自由贸易区的未来发展带来更多的挑战。
　　为此，尽可能地减少中国与东盟在自由贸易区合作中可能发生的风险，促进双方区域经济一体化合作的可持续发展，对目前正在升级的中国—东盟自由贸易区进一步研究就显得十分必要。本文将主要讨论:1.升级版的原由和当前的进程如何;2.自由贸易区的成立给中国与东盟对外贸易发展带来的影响;3.自由贸易区升级版后将给中国与东盟经济与贸易发展带来的影响;4.双方各产业从自由贸易便利化的提升中是否得到福利;5.如何战胜各种内外的不确定性，以及未来自由贸易区升级版如何发展。并按照如下逻辑进行阐述:
　　首先，通过对相关文献的梳理，总结出学界对中国—东盟自由贸易区的相关研究，以及该自由贸易区发展的实际情况，并通过历史分析法进行解析，阐述中国—东盟自由贸易建设的发展历程，从该自由贸易区发展前期至全面建成，而且还对该自由贸易协定的主要内容进行详细梳理解释。其次，通过理论与实践分析阐述了该自由贸易区升级版的背景，以及中国与东盟的自由贸易区战略对双方的经贸合作的影响，并指出了未来合作面临各种可能的挑战和不确定性。再次，分析升级后对双边货物贸易的影响及变化进行定性与定量分析，细分中国与东盟在各类产品的竞争性与互补性，通过使用贸易引力模型对中国—东盟自由贸易区的贸易效应进行实证检验，并通过运用GTAP模型进行模拟预测升级版全面实施后对中国与东盟及中国主要贸易伙伴宏观经济、贸易和福利水平，乃至各国各行业产出和贸易的变化。此外，还设定CPTPP生效所带来的影响。最后，根据上述分析得出的结论，并对中国—东盟自由贸易区升级版未来发展提出政策建议，从而推进中国—东盟自由贸易区全面实现自由化，为双方命运共同体奠定基础提供参考。
　　本文得出的主要结论可归纳为以下几点:
　　第一，从自由贸易区发展现状与贸易效应来看，自由贸易区合作对中国与东盟的经贸发展发挥了重要作用，双边贸易规模不断扩大，双边贸易增长率高于各自的整体对外贸易增速，双边贸易规模占双方对外贸易总额的比重呈现增长趋势，但是双方的贸易差额仍存在不平衡。而随着自由贸易区的发展，中国向东盟出口产品结构倾向于工业制品，而中国自东盟进口产品结构则倾向于初级产品。这与中国和东盟显示性比较优势指数和贸易互补性指数的结果一致，说明中国与东盟各类产品贸易中存在互补关系，但是在一些产品中，双方的贸易仍存在这竞争关系。最后贸易引力模型实证结果表明，中国—东盟自由贸易区的成立，对中国与东盟的贸易额增长发挥着积极作用，说明自由贸易区的建设给中国与东盟带来积极的贸易效应。
　　第二，从自由贸易区升级版未来发展的贸易效应来看，GTAP模型的模拟结果表明，中国—东盟自由贸易区升级版全面实施后给中国与东盟各国的经济增长、福利水平具有显著促进作用。升级版对双方进出口贸易的增长带来积极影响，并给中国与大多数东盟国家的贸易条件进一步改善。但在贸易平衡方面，除了新加坡以外的成员国均出现贸易差额恶化状况。在产业层面，中国与东盟各行业产出和进出口贸易额增长均出现明显增加，贸易差额均得到改善，主要集中在双方各自具有比较优势的产品，相反受到冲击则为各国具有比较劣势的行业。在升级版全面实施的前提下，CPTPP的成立给中国与东盟的经济、贸易增长带来的消极影响并不明显，说明双方贸易自由化的提升可在一定程度上预防区外带来的影响。尽管如此，部分成员因国内产业则受到冲击，而导致其的贸易条件出现恶化。同时还给区外非成员的经济与贸易带来不同程度的消极影响。
　　第三，中国与东盟在自由贸易区合作未来发展仍面临着复杂严峻的内外环境，双方应该加快推进升级版的落实及内容的完善。推进双方发展战略协调与对接，通过推进“一带一路”倡议与东盟共同体《2025蓝图》建设，以互利共赢方式帮助东盟互联互通建设，打破东盟国家经济发展瓶颈，不断地扩大双方经贸合作规模，进一步加强政治互信，并加大推进区内各国之间社会文化和民间的交流，设立中国—东盟自由贸易区秘书处，确保中国—东盟自由贸易区升级版未来发展的稳定、健康和持续发展。