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DNA切割剂是一类结构简单、能引起DNA断裂的重要化合物,同时也是一种潜在的以DNA为靶点的新型药物。对DNA切割剂的研究一直是生物化学、生物学和药学等学科中重要的活跃领域之一。含有N-甲基吡咯和N-甲基咪唑的多聚酰胺可以高亲和力、高选择性的与DNA结合,是一类重要的以DNA为靶点的化合物。将多聚酰胺引入到DNA切割剂中,构建不同结构的新型DNA切割剂,并对其切割性能进行研究,是具有重要理论和应用价值的研究课题。
本论文的主要研究成果如下:1.重氮类光引发活性DNA切割剂的研究将含有三个咪唑环的多聚酰胺与重氮类切割剂相连合成光引发活性DNA切割剂;并运用琼脂糖电泳检测了三种新型重氮类切割剂对pSK超螺旋DNA的切割作用。实验结果发现,多聚酰胺的引入显著增强了重氮类切割剂的切割活性。
2.卤苯类光引发活性DNA切割剂的研究利用卤苯类切割剂结构简单,易于引入的特点,构建了具有新型结构的卤苯类光引发DNA切割剂。并研究了切割剂与多聚酰胺之间的连接基团对切割剂活性的影响。
a.以乙醇胺为连接基团,将溴苯类切割剂连接到多聚酰胺分子中合成了新型光引发DNA切割剂。电泳实验表明,含有两个切割基团的切割剂活性低于含有一个切割基团的切割剂。
b.通过以不同的方式连接卤苯基团和多聚酰胺片段,成功地合成了三个系列六种新型DNA切割剂(分别为卤苯基团连接在多聚酰胺的N端,卤苯基团连接在多聚酰胺的C端,卤苯基团分别连接在多聚酰胺的N端和C端);比较了它们的切割活性,发现溴苯连接在多聚酰胺N端的结构具有最高的切割活性。并运用ESI-MS研究了卤苯类切割剂的切割机理。
3.[Cu(OP)2]+类DNA切割剂的研究a.成功合成了[Cu(OP)2]+类DNA切割剂;并运用ESI-质谱法研究了[Cu(OP)2]+类切割剂及结合分子与G-四联体DNA的相互作用。研究结果发现:[Cu(OP)2]+类切割剂对G-四联体结构有显著的破坏作用;结合分子对G-四联体结构有显著的保护功能。
b.将含有三个咪唑环的多聚酰胺片段引入到[Cu(OP)2)]+类切割剂中,成功地合成了[Cu(OP)2]+-多聚酰胺类切割剂。并选择人体端粒的重复序列5’-(TTAGGG)2-3’和其互补链形成的双螺旋DNA为目标,运用质谱方法研究了此类新型切割剂对双螺旋DNA的切割作用。研究结果显示:该类切割剂可以选择性的切割双螺旋DNA。
4.新型卤苯类DNA切割剂质谱特征和碎裂机理的研究运用ESI-MS对合成的五种新型切割剂的质谱碎裂机理进行了详细的研究,发现了卤苯类DNA切割剂质谱碎裂的规律,并讨论了末端连接基团对该类化合物质谱碎裂的影响。