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茄子(Solanum melongena L.)是世界上重要蔬菜之一，我国栽培面积较大。我国人民经过长期的栽培和选育，培育出许多优良品种，但传统的育种以常规方法为主，育种效率较低，分子标记辅助选择结合常规方法可以加速育种进程。微卫星标记(SSR)是分子育种中常用的遗传标记之一，但目前报道的茄子SSR标记不多，还不能满足茄子分子育种的需要，有必要发展更多的SSR标记。
近缘物种转移法是一种发展SSR标记简便快速的方法，本实验室已经在番茄上开发了大量新SSR标记，将这些标记转移到茄子上，能节省开发茄子SSR标记的成本。本试验对这些番茄SSR标记在茄子上的通用性和多态性进行初步研究，并用SSR标记对茄子资源进行聚类分析；此外，应用SSR标记做锚定标记，确定了本实验室构建的AFLP分子遗传图谱与国际上SSR遗传图谱间的对应关系。主要结果如下：
1.654对番茄SSR引物中有555对能在茄子基因组DNA上扩增出产物，252对引物扩增出的带型在番茄、茄子间相似程度高，标记的通用率为38.5％; EST-SSR比基因组SSR的通用性更好，前者通用率为54.5％，后者为35.2％。15对茄子基因组SSR引物中有9对能在番茄上通用，通用率为60％。不同染色体来源的番茄SSR标记通用率明显不同，说明茄科作物染色体间进化速度存在差异。67对引物在2份栽培茄子间表现出多态，为今后利用分离群体定位重要性状基因打下了基础。
2.用25个SSR标记对从全国各地收集的64份果实大小、形状及颜色性状差异明显的栽培茄子及2份野生茄子进行分析，10个标记在种间表现出多态性，扩增出36个等位变异，平均每个标记检测到3.6个等位变异；但只有4个标记能在茄子栽培种内检测出多态性。全部材料的遗传相似系数在0.13～1之间，但栽培茄子材料的遗传相似性在0.70～1之间，说明栽培茄子遗传基础狭窄。聚类分析将供试材料分为三大类：第一类和第二类各包含1份近缘野生种；所有栽培种归为第三类，其下又分为三亚类。各亚分类和茄子的果实性状、收集地分布都没有对应关系。
3.从已发表的茄子SSR遗传图谱上均匀挑选75对引物，26个标记在本实验室构建AFLP遗传图谱的两个作图亲本间有多态，23个标记被整合AFLP遗传图谱中，但4个标记的分布与原SSR遗传图谱中不相吻合。利用定位的SSR标记做锚定标记，确定了两张图谱间的对应关系，并推测AFLP图谱中至少3个连锁群和其他连锁群存在连锁关系，可能位于同一染色体上。