生态工业园区建设旨在综合利用各交叉学科的理论和方法，实现工业园区资源能源高效利用，同时，尽可能减少经济活动的环境影响。在过去短短的10余年内，生态工业园区建设在全球范围内蓬勃开展起来，然而，由于产业生态学理论自身的不完善以及对生态工业园区生态系统认识的不充分，导致目前生态工业园区建设走入了单纯构建废物闭路循环链以实现废物循环利用的误区，当把大量的资源浪费掉之后再特意设置闭环来对其进行再利用，本身就是一种严重的资源浪费。本研究旨在深入剖析生态工业园区生态系统结构和功能，探索生态产业共生网络的形成和运行机制，拓展和完善现有产业生态学理论，为现实中的生态工业园区建设提供理论依据。本研究主要内容包括： 首先，分析生态工业园区的产生及其经济学本质，指出生态工业园区的兴起是经济发展到一定阶段后解决经济发展和环境保护矛盾的必然产物。在中国特殊的社会、政治、文化氛围中，生态工业园区不仅具有经济发展的必然性，而且具有巨大的政治需求，只要中国的这种特殊政治文化氛围不发生改变，中国的生态工业园区建设就会经久不衰。 其次，在深入分析生态工业园区生态系统特点的基础上，阐释了技术、人才在该类生态系统中的重要性，这也是现有生态系统理论无法很好地解释该类生态系统的原因。在此基础上，构建了基于社会、经济、环境和资源四个子系统的生态工业园区生态系统结构框架，并提出了基于能量流、知识流、物质流、信息流、价值流和技术流的系统功能体系。最后，分析了系统优化调控费用与系统效益之间的关系，结果表明，系统综合效益是系统结构的函数，因此，生态工业园区生态系统优化就是要通过完善或优化系统结构，确保系统各功能流畅通，从而实现系统功能和效益的最大化。 再次，剖析生态产业共生网络中的生产过程及其价值论基础，提出相应的商品价值衡算方法及环境成本内部化策略，并扩展“第三产业”的外延，将产业生态学的研究范畴从生产领域拓展到消费领域。在此基础上，识别目前生态工业园区建设理论的不适应性，从生态产业共生网络优化的角度提出广义产业生态学概念，也即生态工业园区建设理论体系。在该理论体系中，首先考虑从宏观经济系统中找寻从源头上杜绝和减少环境污染的经济学手段和方法，然后，通过产业企业间的环境合作，尽可能从源头上避免污染产生，最后是运用产业共生理论来构建废物资源循环利用链网，以实现废物资源的循环利用，减少废物产生量和末端污染治理费用。 最后，系统地分析生态产业共生网络中企业的五类环境责任：企业环境安全与健康知识培训、环境设计、绿色消费、延伸生产者责任、污染治理和废物资源化。阐述其环境责任的三种市场化机制：业务外包、内部协作整合和合作共生，提出基于委托——代理信任机制、激励机制和合作共生机制的产业共生网络协作机制。在此基础上，构建基于过程控制和节点控制的产业共生链网控制系统，并开发基于产业共生网络运行费用的生态产业优化控制模型。