自迈尔提出地理物种形成概念以来,异域物种形成便广泛成为解释物种分化的最主要机制.异域物种形成理论认为种群间的基因流,会弭平之间的遗传差异,因此种群间地理分隔,可阻却种群间基因流,确保种群持绩分化,最终导致新物种形成.然而,近年来核基因多基因遗传多样性数据,显示基因流普遍存在姊妹种的分化过程.以东亚鸟类为例,分布在台湾及大陆低地的台湾画眉与画眉,或者灰胸竹鸡及台湾竹鸡间,虽然台湾海崃隔离它们的分布范围,但它们的分化过程中,都存在显着基因交流;物种分化期间存在基因流的现象,也发现于繁殖地分隔在南北半球的皇家琵鹭与黑脸琵鹭间.然而对于分布于高海拔而呈现间断分布的酒红朱雀及台湾朱雀，甚至呈临域分布的棕头鸦雀及灰喉鸦雀，遗传数据则显示，这些物种间的分化，存在绝对的基因流中断。因此，地理隔离在东亚鸟类物种形成过程中所扮演的角色，可能并不如原先所设想般普遍，然而非异域物种形成对东亚鸟类物种分化的重要性，则仍需进一步评估。此外，将来对东亚鸟类多样性起源的研究，则应更加关注局部适应等其他机制，在鸟类物种形成所扮演的角色。