疏叶骆驼刺耐盐基因AsNHX的3′-RACE克隆及序列分析

来源 :喀什师范学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Richard0936
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通过Trizol法提取骆驼刺叶片总RNA的方法,反转录合成cDNA,PCR扩增得到一条600-800bp的DNA条带,与报道的AspNHX1基因的核心序列基本相符,经3′-RACE扩增的DNA片段并连接到载体上进行测序.测序结果显示cDNA长度为1484bp,编码470个氨基酸,与猪毛菜SaNHX1 (Salsola affinis)、梭梭HaNHX1 (Haloxylon ammodendron)、盐爪爪 Kf NHX1(Kalidium foliatum)的核苷酸序列同源性高达96%、89%、89%,氨基酸序列同源性达到97% 、93%和90%.生物信息学分析显示AsNHX蛋白的分子式为C4578H7674N1484O1907S291,蛋白的分子量为123347.5,理论等电点pI为5.01,不稳定参数为46.41,是一个富含疏水性氨基酸的不太稳定蛋白,理论上有35个苏氨酸的磷酸化位点,属于NHX1家族.说明己经在骆驼刺叶片中成功的克隆到Na+/H+逆向转运蛋白基因cDNA序列的部分片段,为下一步克隆骆驼刺叶片Na+/H+逆向转运蛋白基因的cDNA全序列提供了可能.
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