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摘 要:为探讨肉质性状候选原癌基因(c-FOS)在国内外不同猪种群体间的遗传变异,本研究以大白猪、杜洛克猪、长白猪、宁乡猪、桃源黑猪、沙子岭猪和大围子猪7个猪种为研究对象,以PCR-RFLP方法检测该基因G2910A位点的遗传变异。结果表明,大白猪、长白猪和杜洛克猪3个外来品种的优势基因型均为BB型,A等位基因是宁乡猪、大围子猪和沙子岭猪3个地方品种的优势等位基因,大围子猪、杜洛克猪和大白猪B是优势等位基因,长白猪全是B等位基因。这与中外不同猪种肉质性状差异较大相一致,本研究为猪肉质性状分子标记辅助选择奠定基础。
关键词:猪;c-FOS基因;PCR-RFLP
中图分类号:S813.1 文献标识码:A 文章编号:1001-0769(2015)04-0064-01
猪原癌基因(proto-oncogene,c-FOS)与肉质性状的系水力、肌内脂肪含量、pH值等有显著相关性,该基因位于猪7号染色体,其cDNA全长1 143 bp。本研究采用PCR-RFLP方法检测了国内外7个猪种c-FOS基因G2910A的基因频率和基因型频率。本研究旨在筛选猪肉质性状遗传标记,以期为该标记应用于猪的育种打下坚实的基础。
1 材料与方法
1.1 样品采集
杜洛克猪74头,长白猪38头,大白猪781头,宁乡猪68头,桃源黑猪70头,大围子猪43头,沙子岭猪81头。剪少量耳组织-20 ℃保存。
1.2 基因组DNA提取及PCR扩增引物
基因组DNA提取按常规酚-氯仿法进行,c-FOS基因G2910A位点PCR-RFLP的左引物为5’-TCT GAG GAG GCC TTC ACC CTG C-3’,右引物为5’-TCA CGC CCA GAT AAG GTC CT-3’。
2 结果与分析
2.1 c-FOS基因G2910A位点PCR-RFLP的分型
c-FOS基因G2910A位点扩增产物为567 bp,限制性内切酶为Tai I,A等位基因为239 bp、204 bp、74 bp、50 bp, B等位基因为313 bp、204 bp和50 bp,AB型为313 bp、239 bp、204 bp、74 bp和50 bp。
2.2 基因频率和基因型频率
在4个地方品种猪中,宁乡猪A等位基因频率为0.970 6,大围子猪中全部为A等位基因,沙子岭猪中A基因频率为0.963,而桃源黑猪B等位基因为0.628 6;长白猪中全部为B基因,大白猪B基因频率为0.984 0。经Hardy-Weinberg平衡状态x2检验,除杜洛克猪此位点处于不平衡状态(P>0.05),其余均处于平衡状态(P<0.05)(表1)。
3 讨论
国内外对猪c-FOS基因与其肌纤维性状的研究已有少量报道,Reiner等对皮特兰×梅山猪二元杂交猪的研究表明,猪c-FOS基因第4外显子有1个多态性位点引起氨基酸的改变。郭云雁等在北京黑猪中发现c-FOS基因G2910A位点存在多态性,3种基因型与肌纤维面积、眼肌面积、肌纤维密度存在显著相关,外来猪种皮特兰猪无多态性,基因型全部为BB型,而中国地方猪种梅山猪的基因型全为AA型。本研究发现大白猪、长白猪和杜洛克猪3个外来品种的优势基因型均为BB型,A基因是宁乡猪、大围子猪和沙子岭猪4个地方品种的优势等位基因,桃源黑猪的B等位基因频率较高,这是因为在桃源猪的选育过程中导入了杜洛克猪的血液。这为进一步研究该位点与猪肉质性状的关联分析及将其应用于标记辅助选择打下基础。
参考文献:(略)
关键词:猪;c-FOS基因;PCR-RFLP
中图分类号:S813.1 文献标识码:A 文章编号:1001-0769(2015)04-0064-01
猪原癌基因(proto-oncogene,c-FOS)与肉质性状的系水力、肌内脂肪含量、pH值等有显著相关性,该基因位于猪7号染色体,其cDNA全长1 143 bp。本研究采用PCR-RFLP方法检测了国内外7个猪种c-FOS基因G2910A的基因频率和基因型频率。本研究旨在筛选猪肉质性状遗传标记,以期为该标记应用于猪的育种打下坚实的基础。
1 材料与方法
1.1 样品采集
杜洛克猪74头,长白猪38头,大白猪781头,宁乡猪68头,桃源黑猪70头,大围子猪43头,沙子岭猪81头。剪少量耳组织-20 ℃保存。
1.2 基因组DNA提取及PCR扩增引物
基因组DNA提取按常规酚-氯仿法进行,c-FOS基因G2910A位点PCR-RFLP的左引物为5’-TCT GAG GAG GCC TTC ACC CTG C-3’,右引物为5’-TCA CGC CCA GAT AAG GTC CT-3’。
2 结果与分析
2.1 c-FOS基因G2910A位点PCR-RFLP的分型
c-FOS基因G2910A位点扩增产物为567 bp,限制性内切酶为Tai I,A等位基因为239 bp、204 bp、74 bp、50 bp, B等位基因为313 bp、204 bp和50 bp,AB型为313 bp、239 bp、204 bp、74 bp和50 bp。
2.2 基因频率和基因型频率
在4个地方品种猪中,宁乡猪A等位基因频率为0.970 6,大围子猪中全部为A等位基因,沙子岭猪中A基因频率为0.963,而桃源黑猪B等位基因为0.628 6;长白猪中全部为B基因,大白猪B基因频率为0.984 0。经Hardy-Weinberg平衡状态x2检验,除杜洛克猪此位点处于不平衡状态(P>0.05),其余均处于平衡状态(P<0.05)(表1)。
3 讨论
国内外对猪c-FOS基因与其肌纤维性状的研究已有少量报道,Reiner等对皮特兰×梅山猪二元杂交猪的研究表明,猪c-FOS基因第4外显子有1个多态性位点引起氨基酸的改变。郭云雁等在北京黑猪中发现c-FOS基因G2910A位点存在多态性,3种基因型与肌纤维面积、眼肌面积、肌纤维密度存在显著相关,外来猪种皮特兰猪无多态性,基因型全部为BB型,而中国地方猪种梅山猪的基因型全为AA型。本研究发现大白猪、长白猪和杜洛克猪3个外来品种的优势基因型均为BB型,A基因是宁乡猪、大围子猪和沙子岭猪4个地方品种的优势等位基因,桃源黑猪的B等位基因频率较高,这是因为在桃源猪的选育过程中导入了杜洛克猪的血液。这为进一步研究该位点与猪肉质性状的关联分析及将其应用于标记辅助选择打下基础。
参考文献:(略)