超抗原TSST-1之靶TCRVβHV4序列的特征分析

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首先对人和小鼠的TCRVβ的氨基酸序列进行多序列对准,就Vβ之HV4片段进行比较,分析与超抗原TSST-1结合的四种Vβ(小鼠Vβ3、Vβ15、Vβ17和人Vβ2)之HV4序列内是否存在特定的氨基酸残基排列主型。结果发现:小鼠Vβ3和Vβ17的HV4具有特异的RFSAXCXSNS主型,而小鼠Vβ15和人β2的HV4则含独特的KFXIXH主型。提示:与TSST-1结合的四种Vβ所对应的T细胞识别表位可能不止一个。 The amino acid sequences of human and mouse TCRVβ were first aligned for multiple sequences and the V4 HV4 fragments were compared to analyze the binding of the four Vβs (mouse Vβ3, Vβ15, Vβ17 and human Vβ2) bound to superantigen TSST-1 Whether there are specific amino acid residues in the HV4 sequence is the main type. As a result, it was found that the HV4 of mice Vβ3 and Vβ17 had a specific main type of RFSAXCXSNS, while the mouse HVS of mice Vβ15 and human β2 contained a unique KFXIXH major type. Tip: The four Vβ binding to TSST-1 may correspond to more than one T cell recognition epitope.
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