【摘 要】
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目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)在银屑病细胞周期信号通路中发挥的功能及其作用机制.方法 通过GEO数据库收集银屑病转录组测序数据集进行分析,筛选差异表达的基因;通过细胞信号通路富集分析(KEGG)识别调控银屑病的关键信号通路;利用加权基因共表达网络分析(WGC-NA)构建lncRNA与蛋白编码基因共表达网络;通过siRNA在人永生化表皮细胞(HaCaT细胞)中敲低LINC01206,流式细胞术检测细胞周期进程.结果 差异表达基因富集分析研究发现细胞周期信号通路的失调参与银屑病发病.lncRNA
【机 构】
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南方医科大学皮肤病医院,广东 广州 510091
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目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)在银屑病细胞周期信号通路中发挥的功能及其作用机制.方法 通过GEO数据库收集银屑病转录组测序数据集进行分析,筛选差异表达的基因;通过细胞信号通路富集分析(KEGG)识别调控银屑病的关键信号通路;利用加权基因共表达网络分析(WGC-NA)构建lncRNA与蛋白编码基因共表达网络;通过siRNA在人永生化表皮细胞(HaCaT细胞)中敲低LINC01206,流式细胞术检测细胞周期进程.结果 差异表达基因富集分析研究发现细胞周期信号通路的失调参与银屑病发病.lncRNA 与蛋白编码基因共表达网络分析表明,LINC01206、LINC01269、LINC01215和LINC02159等通过与细胞周期信号通路关键基因CCNA2、CCNB1 和CCNE1 的相互作用调控银屑病进程.细胞实验结果显示,siRNA在HaCaT细胞中敲低LINC01206,引起细胞周期G2/M的阻滞.结论 lncRNA的表达变化引起银屑病细胞周期失调,细胞周期信号通路中的关键lncRNA有望成为银屑病治疗的靶标.
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