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近交系小鼠在医学与生物学研究领域占重要地位。近交系小鼠遗传质量影响着相关实验的可信度，监测方法主要包括：一般形态学标记、细胞遗传学标记、免疫学标记、生物化学标记和分子生物学标记等。一般形态学标记、细胞学标记、免疫学标记和生物化学标记都是对外在表现型或者遗传物质载体的监测，易受外界因素干扰，并且不能覆盖全部染色体。分子生物学标记包括：限制性片段长度多态性、DNA指纹、随机遗传扩增DNA多态性和串联重复序列。分子生物学标记虽基于DNA水平进行监测，但目前尚无标准遗传背景图可供参考。为高速发展的现代医学服务急需