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胃肠道是人体内最长的管道，长9米，是病毒性肝炎、脊髓灰质炎及多数败血症病原的入侵场所，并且在各段管腔有各种常见易感病原，如近年所认识的幽门螺杆菌（Hp）是胃及十二指肠溃疡、非溃疡性炎症相关的细菌，虽然其发病机制尚未完全清楚，但应用抗菌抗酸联合疗法取得了肯定疗效，为这一发病率极高的炎症、溃疡病以至胃癌的防治带来了希望。近年来，小肠易感的伤寒及结肠易感的细菌性痢疾的治疗取得显著效果，带菌及慢性化者得到了有力控制；但亦有一些新的问题尚待解决。