【摘 要】
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本研究对204 199条茶树花转录组Unigenes进行SSR简单重复序列的查找,得到含有SSR的序列60 581个,出现频率为29.67％.EST-SSR重复类型以单核苷酸和二核苷酸为主,占总SSR比例的85
【机 构】
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云南省农业科学院茶叶研究所,云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心,云南省茶学重点实验室,勐海,666201
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本研究对204 199条茶树花转录组Unigenes进行SSR简单重复序列的查找,得到含有SSR的序列60 581个,出现频率为29.67％.EST-SSR重复类型以单核苷酸和二核苷酸为主,占总SSR比例的85.69％,其中主要重复基序类型为单核苷酸,占总SSR的47.97％,A/T重复类型出现最多.采用荧光标记PCR技术对设计合成的100对SSR引物进行引物筛选,其中有28对引物扩增条带清晰、多态性好,在4个品种的茶树花中得到有效性验证.结果表明,茶树花转录组的SSR标记开发是可行的,这些EST-SSR的开发对茶树花遗传多样性分析、分子育种和开发茶树不育相关的SSR标记等具有重要意义.
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