【摘 要】
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本研究利用生物信息学方法对大白菜的漆酶(p-diphenol oxadise or laccase,LAC)基因家族成员、染色体定位、基因结构、进化树、氨基酸序列及同源表达情况进行了相关分析.结果
【机 构】
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山东省烟台市农业科学研究院,烟台,265500;烟台大学生命科学学院,烟台,264005
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本研究利用生物信息学方法对大白菜的漆酶(p-diphenol oxadise or laccase,LAC)基因家族成员、染色体定位、基因结构、进化树、氨基酸序列及同源表达情况进行了相关分析.结果显示,15个大白菜漆酶基因(BrLAC)家族成员分布于7条染色体上,部分基因存在串联复制现象;基因结构分析显示,该家族基因含2～6个内含子;亚细胞定位及跨膜结构分析表明,BrLAC无跨膜区或仅有一个很短的跨膜区域,主要定位于细胞外及周质;氨基酸序列分析结果表明BrLAC氨基酸序列均含有漆酶的3个典型保守结构域,4个铜离子结合位点;通过与拟南芥LAC进行系统发生分析,将其分为6个亚族;同源分析LAC在不同组织中的表达情况表明LAC在根系和果荚中的表达量较高,在花及叶片中的表达量较低.大白菜漆酶可能代替多酚氧化酶直接参与酶促褐变,值得深入研究.
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