炭疽芽胞杆菌基因组中串联重复序列的研究

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在真核生物和原核生物染色体中存在着具有相同组合而拷贝数不同,并且相互毗邻的核苷酸序列,称作串联重复序列。它们在不同个体之间由于重复数和串联重复序列单位的不同,而使生物具有多态性。目前串联重复序列广泛的应用于分子生物学研究,包括菌株鉴别,基因分型等方面。 1996年,首次发现炭疽芽胞杆菌中存在串联重复序列,随后各国研究者对炭疽芽胞杆菌染色体和质粒DNA上的串联重复序列进行了不同程度的研究。我们应用13个串联重复序列遗传标记对我们实验室保藏的88株炭疽芽胞杆菌进行了研究。研究方法是在炭疽芽胞杆菌染色体DNA上的串联重复序列两侧设计引物,PCR扩增,琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳,凝胶影像分析软件对分子量进行测算,并与测序结果相比较,计算出串联重复数,结果发现中国炭疽芽胞杆菌菌株除了与世界其他国家菌株具有相似性以外,还有自己的特点,表现在等位基因的不同和串联重复数上有差别。炭疽芽胞杆菌基因中的VNTR具有多态性。聚类分析发现,88株菌株可分为45个基因型,基因型与生环境存在一定的关系。研究还发现,同一地方由于各种原因存在着多种多样的变异株。应用MLVA分析显示A16R疫苗株作为中国的疫苗株具有代表性。串联重复序列可以应用于研究炭疽芽胞杆菌基因的分型,在研究基因遗传特征上可能有更重要的意义。
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