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鳗鲡具有很高的营养价值和药用价值，为上等的食用鱼，民间作为滋补食品。我国是世界上最大的鳗鲡生产国，鳗鲡产品出口额在单项农产品出口额中占据首位。由于人们对我国沿海日本鳗鲡苗种资源的过度捕捞，导致日本鳗鲡苗种种质资源极度匮乏且供给不稳定，因此最近几年我国引进了新的鳗鲡品种进行养殖。鳗鲡形态十分相似，因此在新品种引进后容易造成种质资源混乱。本研究利用AFLP技术及线粒体DNACOⅠ和COⅡ分子标记技术对几种鳗鲡的苗种进行种质鉴定，并研究几种鳗鲡苗种对高低温的耐受性，以期为鳗鲡新品种的推广养殖提供基础资料。1．以日本鳗鲡（Anguilla japonica）、欧洲鳗鲡（A. anguilla）、美洲鳗鲡（A. rostrata）、印尼鳗鲡（A. bicolor Pacifica）、菲律宾鳗鲡（A. mormorata）五种鳗鲡的幼鳗为实验对象，讨论其对极限高、低温的耐受性及种间差异。实验结果表明：不同种的鳗鲡幼鳗对环境温度的耐受范围具有种间差异。日本鳗鲡、美洲鳗鲡、欧洲鳗鲡、印尼鳗鲡、菲律宾鳗鲡高温“死亡高峰温度”分别为39℃、38℃、37.5℃、39℃、38℃，日本鳗鲡对高温的耐受性最好，欧洲鳗鲡耐受性最差，但种间差异不显著；日本鳗鲡、美洲鳗鲡对低温的耐受性最好，能在冰水混合物中生存，欧洲鳗鲡、菲律宾鳗鲡、印尼鳗鲡对低温耐受性依次减弱，低温“死亡高峰温度”分别为2℃、5℃、10℃。2．利用扩增片段长度多态性（Amplified fragment length polymorphism，AFLP）标记技术研究日本鳗鲡、欧洲鳗鲡、美洲鳗鲡、非洲鳗鲡、印尼鳗鲡、菲律宾鳗鲡6种鳗鲡群体的遗传多样性和群体间遗传分化。8对引物在180个个体中共扩增出519个位点，遗传多样性结果显示，6种鳗鲡的多态位点比例（P）介于54.62%-63.85%之间，其中印尼鳗多态位点比例最低为54.62%，欧洲鳗多态位点比例最高为63.85%；平均每位点等位基因数（A）介于1.5462-1.6385之间，平均为1.5918；平均每位点有效等位基因数（Ae）介于1.2657-1.3289之间，平均为1.3040；Shannon氏指数（I）介于0.2520-0.3066之间，平均为0.2810；Nei’s基因多样性指数（H）为0.1632-0.2002，平均为0.1837，说明6种鳗鲡都具有较高的遗传多样性。群体间遗传分化结果显示欧洲鳗与美洲鳗遗传距离（D）最小为0.0543，其次是菲律宾鳗和印尼鳗，遗传距离为0.1253，其余鳗之间的遗传距离介于0.2377-0.3030之间。通过聚类分析结果显示，6种鳗鲡聚为2大类，美洲鳗、欧洲鳗聚为一支然后和非洲鳗再聚为一支，印尼鳗、菲律宾鳗聚为一支然后和日本鳗再聚为另一支。同时利用AFLP技术对6种鳗鲡进行种质鉴定，通过E-AAG/M-CGT和E-AAG/M-CTT两对引物中的5个特异性位点能够对6种鳗鲡进行有效的鉴别。3．对日本鳗鲡、欧洲鳗鲡、美洲鳗鲡、非洲鳗鲡、印尼鳗鲡、菲律宾鳗鲡6种鳗鲡线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）和细胞色C素氧化酶亚基Ⅱ（COⅡ）基因片段碱基序列进行比较。6种鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列均为652bp，6种鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列共有105bp的差异，其中有18个位点发生碱基颠换，87个位点发生碱基转换；6种鳗鲡COⅡ基因片段核苷酸序列均为412bp，6种鳗鲡COⅡ基因片段核苷酸序列共有46bp的差异，其中6个位点发生碱基颠换，40个位点发生碱基转换。在6种鳗鲡COⅠ和COⅡ基因片段中A、T、G、C含量非常相似，并且A+T的含量都大于G+C的含量。