随着差异表达蛋白质组学在疾病等研究领域的广泛应用，蛋白质组学研究已成为当前生命科学的一个热点研究领域。蛋白质组学研究中的蛋白质翻译后修饰分析同蛋白质表达水平分析一样，对于理解样品中蛋白质复杂多样的生物学功能都是十分重要的。二硫键是一种常见的蛋白质翻译后修饰，对稳定蛋白质的空间结构，保持及调节其生物活性等都有着非常重要的作用。现代质谱技术因其操作简单、快速、灵敏等优点而成为蛋白质组和二硫键分析的重要手段。本论文的研究目的是采用蛋白质组学研究技术寻找白血病肿瘤细胞中与耐药相关的靶蛋白，并对几种蛋白质和多肽中的二硫键进行质谱分析。具体内容分为以下几个部分：　　 第一章，综述了质谱在蛋白质组学及二硫键分析中的应用，并提出本文的总体研究思路。　　 第二章，采用蛋白质组学的分析方法中双向凝胶电泳技术，对白血病细胞敏感株K562与耐药株K562/A02及其分别加入抗耐药肿瘤新药PHII-7后细胞总蛋白进行差异分析。　　 第三章，利用基质辅助激光解离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定了55个差异蛋白质中的45个蛋白点。经初步分析鉴定出的蛋白质功能涉及各种不同的生命进程。　　 第四章，研究了应用质谱分析三种蛋白质的酶解肽段混合物时由于二硫键断裂产生的Prompt碎片离子。结果观察到了一组分别间隔32Da的不同丰度的“triplet”碎片离子特征峰，这组碎片离子特征峰是由二硫键的对称和不对称断裂产生的，这是首次在普通反射模式下发现这种二硫键的prompt碎裂方式。　　 本论文成功的将蛋白质组学研究方法应用于白血病耐药细胞系K562/A02的差异蛋白表达分析，研究表明K562/AO2的耐药机制比较复杂，所得结果能够加深对肿瘤耐药病理机制的理解，并为今后进一步研究白血病耐药机制提供有用信息。另外，本论文的研究表明在进行MALDI质谱分析时，未经还原的蛋白质酶解肽段混合物可能发生二硫键的源内prompt碎裂。对质谱中二硫键的这种类型的碎裂进行认识研究是非常有意义的。一方面，这提醒人们在分析含二硫键多肽的MALDI-MS数据时要特别小心以免作出错误的判断。另一方面，这将成为一种鉴定含有二硫键肽段的非常有效的手段，同时也提供了一种获取有关二硫键信息的简便方法。