通过微生物或酶来处理烟叶可以高效专一地降低烟草生长及加工过程中所积累大量有害成分，如尼古丁及烟草特有亚硝胺等，亦不会对烟叶的主要品质产生不利影响，可较好的避免通过遗传改良或是化学手段等降低这些有害物质时对烟叶的光泽、香气等其他特性的损害以及对环境的污染。 本研究以烟草叶片为材料，分离得到22株可利用尼古丁为唯一碳源生长的细菌菌株。其中的优势类群为Pseudomonas sp，此外还包括Bacillus sp．、Pantoea sp．Cellulosimicrobium sp．以及Sphingomonas sp．等不常见的尼古丁降解菌。从烟草叶片分离的尼古丁降解菌株，对尼古丁的降解率在70.58％-93.66％之间。本研究还以烟株根围土以及卷烟厂废水等为材料，分离得到33株也能利用尼古丁为唯一碳源生长的细菌菌株，其中编号为J5和N7的两株细菌具有极强的尼古丁降解能力，降解率分别为98.53％和95.50％，可用于进一步对降解机制的研究。 了解烟叶生产加工不同阶段微生物的变化情况，可以为微生物在烟草上的利用提供理论依据。因此，对烟叶的细菌区系的研究，显得尤为必要。本论文以调制过程中的白肋烟TN86烟叶为材料，通过直接提取样品细菌基因组总DNA，并对16S rDNA进行PCR扩增以及建立克隆文库的方法，分析烟叶中细菌的多样性。研究结果表明，调制过程中烟叶细菌的优势种群为假单胞菌属(Pseudomonas)，不动杆菌属(Acinetobacter)代尔夫特菌属(Delftia)及泛菌属(Pantoea)，且在调制过程的不同时期，还分别存在欧文菌属(Erwinia)，肠杆菌属(Enterobacter)等非优势细菌种群。首次通过未培养方法对调制过程中烟叶细菌多样性的研究，为研究微生物在烟叶调制过程中的作用机理以及利用微生物提高烟草产品的品质及安全性提供了理论基础。