孔教会得以创立有其复杂的因缘。从中国思想内部发展来看，传统儒学的宗教性为康有为提供了创教的丰富营养；从组织渊源来看，以康有为为首的维新派(保皇派)设立的一系列尊孔保教组织为孔教会的正式成立提供了范本经验；从外部刺激来看，康有为最初的创教思想旨在建立一个能与“洋教”相抗衡的国教，而民初废止尊孔读经的大趋势则直接促成了孔教会的建立。孔教会特别重视定名，可谓咬定“教”字不放松，不仅始终强调以教名会对孔教是宗教及传布孔教的特殊意义，而且不断将其他尊孔组织合并于自己麾下，严格区分国内外与其定名相似的组织。然而，正是孔教会所强调的“孔教是宗教”，1937年国民党政府因此将曲阜孔教总会改称为“孔学总会”。 孔教会的宗旨是“昌明孔教，救济社会”，不但制作悬挂寓含深意的孔教会教旗，又名一贯旗，及大成圣节旗，1922年还开始发给会员徽章，强调识别会员身份以振兴孔教。孔教会设有总会事务所、支分会事务所、支会联合会(部)及附属组织。1912年设总会事务所于上海，次年第一届全国孔教大会后，总会事务所移至北京，1914春，康有为又令将总会移至曲阜，意在仿照西方宗教，将曲阜视为圣地。1920年，增设广州总会事务所。据现有史料的保守统计，孔教会支分会至少230处，分布于全国大部分省份，海外孔教会有二三十处，主要集中在东南亚与美洲。支会联会(部)多设在省城，地位介于总会与支分会之间。孔教会还临时成立了国教维持会、各省公民尊孔会。总体看，孔教会的组织比较松散。 孔教会一直重视发展会员，对入会者几乎没有限制，来者不拒。1920年，陈焕章撰成《行教方针》，主张以后发展会员侧重已往被忽略的青年、妇女、农、工、商、兵。因而，孔教会会员极为复杂，各界均有，但主体是读书识字的“士夫”。30年代后，随着各地组织的衰落，会众锐减。 围绕着尊孔读经，孔教会开展的活动主要有定孔教为国教，定期举行讲学会，创办孔教学校，发行报刊、祀天配孔，争夺学田，保存文庙、筹建会堂等。相应的，孔教会的理论学说主要有：孔教定为国教天经地义；民国的长治久安需要依赖孔教；尊孔必须读经；孔教是中国的国魂，其伦理道德万古不易。 大体上看，孔教会的演变经历四阶段：1912年至1917年、1918年至1927年、1928年至1936年、1937年至今。孔教派儒学宗教化的尝试是失败的，其在某些方面开导了现代新儒学的先河。