本文旨在通过实证分析，考察我国公共部门与私人部门工资差异的大小和造成差异的原因。本文采用《中国居民营养健康调查报告》2006年的截面数据，选取来自包括辽宁、江苏、湖南等9个省的1281个乡镇全职劳动者样本，基于明塞尔简单工资方程对数据作多元回归。总体回归方程加入反映劳动者工作单位属于公共部门或私人部门的“部门性质"变量，检验在控制了劳动者教育、工作经验、性别、职位、身份、区域等重要变量后，部门性质对劳动者月均基本工资和小时工资的影响。这一影响效应本文称为“部门分割效应”，正的公共部门分割效应则称为“部门优势”。结果显示，公共部门与私人部门之间的工资差异主要由劳动者个人特征、企业特征和市场分割因素等三类变量造成。同时，在其他条件相同的情况下，公共部门的月均基本工资略低于私人部门；但若把补贴、奖金以及工作时间等因素也纳入研究范围构成工资总额的概念，则公共部门显示出了显著的“部门优势”。进一步地，本文研究了不同群体享有的公共部门优势大小，结果证明女性和低学历群体享有的优势大于男性和高学历群体；而乡镇地区、非正式员工却分别比城市地区、正式员工享有的部门优势小得多，反映了“部门分割效应”在一定程度上加强了“区域分割”和“体制分割”等其他形式的劳动力市场分割效应。另外，本文对公私两部门的回归方程进行Oaxaca分解，得出仅仅由于部门性质差异而造成的工资差异占总差异构成的42％的结论。最后，本文就如何消除公共部门与私人部门工资差异的不合理部分提出建议，包括统一财政预算、优化公共部门内部工资结构、提高公共服务市场竞争性等。