长期以来,我国的药物研发领域都以仿制药为主，要想提高自主药物创新能力、建设创新型医药产业就要从源头抓起。创新药物研究的起点和源头就是化合物资源的利用。因此,国家化合物样品库的建立肩负着带动整个行业的使命。世界各国的化合物样品库要么为公司所有，要么隶属于研究机构,由公益基金及政府运营。　　本文旨在为国家化合物样品库的商业化道路提供理论依据并设计、分析可能的商业模式，使得国家化合物样品库有可能成为全球第一个能独立运营的公共化合样品库。通过对国家化合物样品库的自身优势、所处环境的分析，为国家化合物样品库设计了一条以资源和服务为驱动，通过开放式的商业模式打造多边平台，以多边平台商业模式支撑公益服务的商业化道路，即依靠一种赢利的模式来实现他的非财务性社会使命。本文对国家化合物样品库商业模式的基本构成板块进行了设计和分析，认为通过正确的商业模式国家化合物样品库有望逐步脱离政府的资助。