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病原体对宿主的入侵会导致宿主免疫系统的免疫应答反应。这些免疫反应包括宿主对病原体的识别，信号的传递以及各种细胞炎症因子及干扰素的产生。宿主的免疫反应必须被精确的调控，当这种调控发生紊乱时，有可能导致自身免疫疾病的发生。Zc3h12a是新发现的对炎症反应进行调控的一个蛋白质，其能在mRNA水平上负调控细胞因子IL6及IL12在细胞内的表达水平。Zc3h12a属于CCCH类型的锌指结构蛋白家族，其在N端含有一个核酸酶结构域，能够特异性的降解IL6及IL12的mRNA，在中间含有一个CCCH类型的锌指结构，这类型的锌指结构往往与核酸的结合相关。在本文中，我们报道了Zc3h12a的核酸酶结构域的2.0A分辨率的晶体结构，我们的结构显示Zc3h12a的核酸酶结构域采用了一种核酸酶中常见的双金属离子型活性位点。对活性位点突变体的构建及体外核酸酶活性实验验证了对于其核酸酶活性起到关键作用的氨基酸残基。此外，我们的体外酶切实验表明，CCCH锌指结构域对于Zc3h12a的活性并不是必需的，揭示出可能存在其他的核酸结合位点参与了与RNA的结合。我们在Zc3h12a活性位点的旁边找到了一片强烈的正电荷区域，可能参与了蛋白和RNA的相互作用。
Ral属于小G蛋白Ras超家族的成员，其参与了许多细胞活动如细胞生长，分化及囊泡运输。在人体中，Ral家族包含了RalA及RalB两个成员。和其他小G蛋白一样，Ral也有结合GTP的活性状态以及结合GDP的失活状态，Ral在这两个状态间的转变是受到鸟苷酸交换因子(GEF)及GTP酶激活蛋白(GAP)的调控的。到现在为止，已经有6个特异性调节Ral活性的GEF蛋白在人体中被发现，他们是Rlf，RalGDS，Rgl，Rsc，RalGPS1 and RalGPS2。RalGPS1和RalGPS2区别于其他四种GEF蛋白的地方在于，它们不含有Ras蛋白的结合结构域，表明他们的活性不受Ras-6TP的调控，而其他四种蛋白均含有Ras结合结构域且能被Ras-GTP所激活。我们解析了RalGPS1a的GEF结构域的晶体结构。RalGPS1a的GEF结构域与另外一个GEF蛋白，Son of Sevenless(SOS)的GEF结构域非常类似，我们根据SOS与Ras的复合物结构，提出了RalGPS1a GEF结合底物Ral的可能机制，SOS GEF与RalGPS1aGEF的差别主要在于活性位点处的一个α螺旋发卡结构的差别。RalGPS1a的GEF结构域在单独表达时是具有GEF活性的，而SOS的GEF结构域在单独表达时却不具有GEF活性。该α螺旋发卡结构的差别可能是其功能差别的结构基础。