随着我国经济快速发展,企业处于竞争激烈的外部环境中,想要稳固并提升企业地位,就需要不断实现企业价值,不断发展并扩大市场,此时企业需要重点关注内部控制,因为内部控制的有效执行,不仅直接影响到企业经营和治理的全过程,还影响到企业被出具的审计意见,最后影响企业价值。我国制造业目前发展缓慢,其内部控制整体水平虽已有提升,但还是存在观念不成熟、制度不完善等问题,上市公司被出具的非标准审计意见也主要集中在制造业。以往学者对内部控制单个变量、内部控制与审计意见关系、内部控制与企业价值关系的研究较多,但对于审计意见与企业价值关系,以及三者之间关系的研究相对较少。通过选取制造业上市公司2015-2019年的数据进行回归分析、对黄河旋风的案例研究得出以下四个结论:内部控制运行越有效,企业价值越高;内部控制执行有效可以降低企业被出具非标准审计意见类型的概率;审计意见在内部控制与企业价值间起到了部分中介作用,内部控制通过影响审计意见类型对企业价值起作用;对黄河旋风的案例研究分析发现如果内部控制存在缺陷,会影响财务信息,进而影响注册会计师的审计过程,是影响到公司被出具何种审计意见类型的重要因素。最后,结合分析结果与现实情况,从上市公司、会计师事务所、监管者三个层面对加强内部控制建设提出了相关建议。