事业单位作为社会组织单元中的重要组成部分，已全面实行岗位绩效工资制度，对其中的奖励性绩效工资采取灵活多样的分配方式和办法。近年来针对性地改革不断深入，尤其在薪资待遇方面，伴随着事业单位绩效工资制度的实施，其在完善事业单位薪酬奖励方式、调动职工主观能动性，提高人事的科学管理，增强事业单位公益效应等方面成效显著。但是绩效工资组成并不单一，各行业、部门也存在差异性，在绩效工资改革中，对于其中的奖励性绩效工资部分要求各个事业单位结合自身实际，制定绩效考核方案并以此为依据进行分配。但在绩效工资落地过程中，较多事业单位并没有领会绩效分配的意义，也就无法有效使用奖励性绩效工资，一些员工改革之初的兴奋和干劲也逐渐褪去，使得奖励性绩效无法达到提升员工积极性的目的，严重制约了绩效工资制度的正常运作。因此在绩效工资制度全面落实过程中是否通过公平合理地分配，真正发挥激励功能，激励每个工作人员努力工作，对于事业单位人力资源管理而言至关重要。如何进一步完善事业单位绩效工资制度，提升绩效工资分配的公平性与合理性是需要我们进一步探讨的。
　　本文采用了问卷调查法、文献研究法等研究方法，以杭州市萧山区农业农村局所属事业单位为研究对象，针对数家不同类型事业单位薪酬制度的运行机制、考核办法、分配依据、发放兑现等环节进行探究。通过调查统计分析现行薪酬制度影响激励效果的根源，收集提升激励效果的有效因素，从而发现在制度建设、考核体系设计、薪酬分配发放、绩效观念等方面存在的问题、面临的挑战，并在此基础上提出完善薪酬制度，有效发挥激励作用的对策，如建立主管部门考核、完善个人考核方案、健全配套机制来实现绩效考核的有效实施和薪酬分配的公平公正，通过一系列具有针对性的可行性策略，不断推动事业单位薪酬制度的完善，激发基层事业单位员工积极性、增强事业单位综合竞争能力，进而为其他事业单位实施奖励性绩效工资提供可借鉴的经验。