R&D项目投资的根本特征是高风险、高成长和高预期收益。这些特征使得R&D项目投资明显区别于企业一般的项目投资，也使R&D投资的运作方式与评估过程不同于其他的投资项目。投资者在筹集到R&D投资基金后，一般投资于拥有高新技术项目的创业企业，而R&D投资成功的关键在于投资者在投资项目的管理中能否采用灵活的应变措施，以应变复杂多变的商业环境。 如何评估R&D投资项目的价值是R&D投资的一个非常重要的课题。传统的项目评价方法(如净现值法)由于不能很好的处理投资管理中的灵活性问题，因此在评价一个投资项目时往往与项目本身的实际情况有很大的出入。实物期权方法是金融期权理论在实物资产投资上的运用和拓展：拥有某个投资机会的投资者有权利进行这个项目的投资，但没有义务一定要执行或马上要执行这个项目的投资。很显然，这种灵活性或选择性的存在增加了项目的投资价值并减少了风险。实物期权理论能够合理地模拟和评价这种复杂的投资机会，解释并评价动态的项目管理以及时间依赖性等，并估算出项目投资过程中所保留的各项灵活性或选择权的价值，而这些特点正是R&D投资项目所具有的。所以，实物期权方法为R&D投资项目的价值评估提供了一个强有力的工具。 本文围绕实物期权理论在R&D投资决策中的应用问题，首先介绍了金融期权与实物期权的理论，分析了实物期权定价的特点，并对金融期权与实物期权做了比较分析。接着，文章分析了R&D投资的特点及其实际运作过程、我国R&D投资的发展现状及其存在的问题，重点研究了R&D投资中所蕴涵的实物期权特征。文章的第三部分比较分析了传统的净现值法与实物期权方法的区别与联系。理论研究的深入是为了实践应用，在第四章笔者构建了多阶段R&D投资下运用实物期权方法定价的框架：以扩展的净现值法计算公式为基础，运用金融复合期权“Geske定价模型”，构建了一个评价三阶段R&D投资项目价值的综合模型，并在第五章结合一个R&D投资项目的具体案例分析，应用构建的模型来评估该R&D投资项目的价值。最后笔者还对实物期权方法在R&D投资中的应用前景进行了展望。