重庆是我国是我国西部地区唯一的直辖市,区位优势突出,战略地位重要,是西部大开发的重要战略支点,在国家区域发展和对外开放格局中具有独特而重要的作用。本文首次对重庆市3E系统协调发展问题展开研究;搜集整理了重庆市2000~2014年期间能源、经济、环境方面指标的数据,首次将废水中化学需氧量COD、饮用水质水源达标率、非公有制企业生产总值指标选择为3E系统评价指标,构建了包括36个指标的3E系统协调发展评价指标体系。本文首先借助Eviews、Matlab数据分析软件,运用EKC曲线、协整分析、格兰杰因果检验、灰色关联分析方法,分析了重庆市3E系统的作用机制;其次,借助SPSS数据分析软件,在构建3E系统协调发展评价指标体系的基础上,运用主成分分析、离差分析、耦合分析方法,测度重庆市3E系统的协调发展水平。研究发现:(1)重庆市工业废物的排放量(废水、废气、废固、二氧化硫、粉尘)与经济增长之间存在倒“U”、倒“N”、正“N”三种类型的曲线关系;(2)重庆市能源消费与经济增长之间具有长期均衡关系,协整向量为(1,-0.6722),并且能源消费与经济增长之间的“增长假说”在重庆成立;(3)重庆市工业废物排放量(废水、废固、二氧化硫、粉尘)均与煤炭消费的关联度最大;(4)重庆市2000~2014年期间3E系统协调发展状况良好的年份不足1/3,3E系统协调发展水平的均值为0.537,总体处于勉强协调发展状态。