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目的:研究Nicastrin(NCT)基因启动子区多态性与散发阿尔茨海默病(sporadic Alzheimers disease,SAD)发病的关系及其机制。
方法:随机选取25名SAD患者和25名正常对照者,扩增NCT基因转录起始点上游约2245bp启动子区基因片段,进行测序。用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction—restriction fragment length polymorphism,PCR—RFLP)的方法或直接测序的方法对中国汉族359例SAD患者和331例正常对照者进行NCT基因多态性分型。用SPSS11.5统计软件包进行等位基因和基因型分布的比较及它们与疾病的关联分析。选取双荧光报告基因系统(pGL3—Basic及pRL-TK)为报告基因载体,用基因重组的方法构建含不同基因型启动子的报告基因质粒,转染入神经母细胞瘤细胞(SH—SY5Y细胞)和人宫颈癌上皮细胞(Hela细胞),检测荧光素酶的活性,计算相对荧光素酶活性(relative luciferase activity,RLA)以表示不同启动子质粒的转录活性。同时检测分别用血清剥夺、缺氧、H2O2及Aβ25—35处理后各启动子转录活性。用SPSS11.5统计软件包进行统计分析。
结果:1、中国北方人群中的NCT基因启动子区ATG上游2245bp范围内存在3个单核苷酸多态性位点(SNP):—436C/T(rs1324738),—796T/G(rs10752637)和—1216C/A(rs2147471)。
2、—436C/T等位基因和基因型频率在SAD和正常对照组中没有显著性差异,经APOEε4分层后依然如此;—796T/G基因型频率在SAD和正常对照组中有显著性差异(P=0.009),在不携带APOEε4的亚组中,基因型频率也存在显著性差异(P=0.005),而在携带APOEε4的亚组中没有显著差异,这表明—796T/G多态性可能是独立于APOEε4而影响AD发病的;另外,—1216C/A等位基因和基因型频率在SAD和正常对照组中有显著性差异(基因型P=0.017,等位基因P=0.031),经APOEε4分层分析后发现,在携带和不携带APOEε4等位基因的亚组中其等位基因频率和基因型频率都具有存在统计学意义(携带APOEε4组:等位基因P=0.006,基因型P=0.013;不携带APOEε4组:等位基因P=0.035,基因型P=0.018)。多态性位点—436C/T与—1216C/A之间存在连锁不平衡(D=0.815,r2=0.064),—796T/G与—1216C/A同样存在连锁(D’=0.818,r2=0.342),从而构成了相对增加AD发病风险的单体型—436C/—1216C(OR=1.244,95%CI=1.005~1.539;P=0.044),相对降低AD发病风险的单体型—436C/—1216A(OR=0.778,95%CI=0.624~0.970;P=0.025)和—796G/—1216A(OR=0.795,95%CI=0.636~0.995;P=0.045)。
3、根据统计学分析结果,构建三种启动子质粒pGL—CGA、pGL—CGC和pGL—CTC,它们的转录活性在Hela细胞和SH—SY5Y细胞中均无明显差异。然而在缺氧(Na2S2O4)条件下,三种启动子转录活性在两种细胞中较非处理组均明显增高。
结论:中国北方人群中的NCT基因启动子区ATG上游2245bp范围内存在3个SNPs:—436C/T(rs1324738),—796T/G(rs10752637)和—1216C/A(rs2147471)。其中—796T/G与—1216C/A这两个位点与SAD的发病具有相关性,但经功能学研究,未发现这两个多态性位点明显影响NCT基因转录活性,即未发现—1216C/A与—796T/G具有功能学意义。