伴随着社会主义市场经济的不断完善和发展，传统的国家全能主义正在逐渐退出经济和社会领域，政府把职能更多的定位在公共服务和社会管理上，然而由于政府效率低下、官僚惰性严重、职责不清、信息的不对称等缺陷，政府不可能及时、全方位的满足广大民众的需求。而非营利组织在环境污染、教育、医疗、社会救济等公共服务领域作出了巨大的贡献，很大程度上弥补了市场和政府的失灵，本文从政府和非营利组织的关系着手，在充分考虑我国国情的基础上，分析我国非营利组织在政府职能转变中的作用，并挖掘这种作用不到位的问题以及原因，在吸收和借鉴国外的非营利组织发展经验的基础上，通过完善我国非营利组织发展的内部建设和外部环境，进而发挥非营利组织在政府职能转变中的作用，推进政府职能的转变。政府职能的进一步转变，迫切要求大量的非营利组织来承担部分公共事务的管理任务。理顺非营利组织和政府之间的关系，研究非营利组织在政府职能转变中的作用，一方面,可以挖掘公民的政治主体意识和政治参与意识，为公民政治参与建立渠道，实现公民的有序、有效参与。另一方面,非营利组织的良性发展还可以弥补政府的公共服务缺失，促使政府精简机构，维护社会稳定，促进社会和谐和稳定。