第一部分:二代测序技术对病毒性脑（膜）炎诊断价值的Meta分析目的:进行二代测序技术对病毒性脑（膜）炎诊断的荟萃分析,即Meta分析,收集整理、综合分析多中心数据样本,从而通过对二代测序技术诊断价值的评估,以利于指导临床治疗,改善患者预后结局。方法:本文书写遵循诊断准确性研究的报告指南,即STARD-2015指南要求,评价二代测序技术与传统诊断学方法对病毒性脑（膜）炎的诊断意义,收集相关数据,严格控制纳入排除标准,对国内外有关于二代测序技术诊断病毒性脑（膜）炎的研究进行了全面检索。检索英文数据库有Pub Med、EMBase及The Cochrane Library;中文数据库:中国知网、万方及维普数据库。检索要设置的时限是建库至2020年12月。英文依据PICOS策略原则分别进行对象“viral encephalitis”、干预措施“NGS”、对照措施“electroencephalogram、iconography、PCR”、结局“diagnose”、设计研究类型“diagnostic study”,进行组合完成检索;中文检索关键词“二代测序”、“病毒性脑炎”、“诊断”等。通过文献资料筛选获取检索相关文献、排除重复文献、进行初步排查、阅读摘要排除、精读全文几步,确定纳入研究的相关文献。对于文献的一般资料,包括作者、发表日期,诊断参数有真阳性值、假阳性值、真阴性值、假阴性值,进行了文献资料提取。通过QUADAS-2风险评估表标准要求,完成文献质量评估。将入选的统计学数据运用Stata14软件进行处理,完成诊断性研究的Meta分析,包含异质性检验、敏感性分析、诊断效能评价和发表偏倚评价。结果:本研究共纳入13篇文献,共涉及病毒性脑（膜）炎患者588例,在这其中有英文文献10例,中文文献3例。研究中有明确提及一致性概念的6例,阳性结果指出二代测序技术有诊断价值的12例,阴性结果1例,文献质量评价结果显示所选的研究都明确研究了病毒性脑（膜）炎疾病,9个研究接受了参考标准检验,4个研究对参考标准未进行明确阐述,6个研究参考标准和检测手段双盲并不明确。总体上,在应用QUADAS-2风险评估表标准完成文献质量评估,在病例选择、待评价试验、金标准、病例流程和进展情况四方面完成相关问题、风险程度及临床适用性评价,文献总体质量良好。Meta分析结果显示:灵敏度的合并值0.69,95%CI:0.55-0.80,特异度的合并值0.53,95%CI:0.32-0.72;森林图表示,灵敏度的Q检验P<0.01,I2=79.49%,说明纳入研究间的异质性有统计学意义,异质性明显,特异度的Q检验P<0.01,I2=91.08,异质性明显,合并ROC曲线下面积（AUC）0.67,分析结果显示二代测序技术对病毒性脑炎诊断具备一定灵敏度、特异度,虽效能高,但存在异质性,分析原因,存在选择偏倚。分别将纳入文献逐一排除后重新分析,排除后曲线值无显著变化,说明纳入的13篇文献稳定性较好,结果可信。结论:1.通过对于纳入的文献进行汇总分析,总结发现二代测序技术对病毒性脑（膜）炎诊断具备一定灵敏度和特异度。2.纳入文献总结发现二代测序技术诊断病毒性脑（膜）炎具备一定优势。但研究仍处于早期,存在异质性,分析原因,存在选择偏倚。3、二代测序技术可以作为病毒性脑（膜）炎早期明确诊断、识别病原微生物、鉴别诊断的一种诊断方法,应用于临床。第二部分:二代测序技术对病毒性脑（膜）炎的诊断性研究目的:本部分拟在探讨二代测序技术对病毒性脑（膜）炎早期诊断的价值,与传统学ELISA法相比诊断优势,从而为临床精准高效诊断病毒性脑炎提供选择与参考。方法:收集2019年1月-2021年3月在延安大学咸阳医院神经内科、儿科等收住入院临床疑似诊断为病毒性脑（膜）炎的68位患者信息,包括一般资料,实验室检查结果,及进行二代测序患者基因检测结果,进行统计学分析。结果:1.分别对以下临床资料进行计数分析,显示性别,发热、头痛、精神行为异常、意识障碍、眼部活动障碍、共济运动异常、脑膜刺激征等症状学,影像学、脑电图实验室检查结果,并发症状电解质紊乱及临床结局抗病毒治疗是否有效,两组进行比较,差异均无统计学意义（P>0.05）;高级智能减退两组进行比较,卡方检验X2=5.810,P值=0.016,P值<0.05,证明两组间高级智能减退差异有统计学意义。2.二代测序组与传统诊断组进行计量资料独立样本检验,结果显示,二代测序技术诊断组脑脊液淋巴细胞计数57.7±35.4,传统方法诊断组脑脊液淋巴细胞计数32.6±35.1,两组P值=0.005,P值<0.05,证明两组间脑脊液淋巴细胞计数的差异有统计学意义,且差异显著。3.进行卡方检验,X2=6.076,P值=0.014,P<0.05,证明用二代测序技术诊断组和用传统方法诊断组差异有统计学意义,表明用二代测序方法在诊断阳性率（35.1%）上优于用传统诊断方法（9.7%）。4.本实验共入组68例（临床综合诊断为病毒性脑炎）,其中使用二代测序方法的共37例,ELISA方法的有31例。（1）37例二代测序阳性为13例,明确病原微生物,其中:单纯疱疹病毒1型---2例,单纯疱疹病毒2型---1例,人类疱疹病毒6A感染---1例,水痘带状疱疹病毒---6例,EB病毒感染---2例,巨细胞病毒---1例。（2）31例未用二代测序的病例中,有2例用传统ELISA法测得人类巨细胞病毒Ig G抗体>4倍,有1例测得EB病毒壳抗原Ig G抗体>4倍。结论:1.临床表现、脑脊液细胞学、磁共振、脑电图对于病毒性脑（膜）炎诊断具有一定提示作用,但缺乏特异性。2.二代测序诊断方法在诊断阳性率上优于传统脑脊液ELISA方法。3.二代测序技术诊断阳性率还需进一步提高,特异度和灵敏度仍然有必要进一步提高,以减少临床误诊率。