人体肠道内的各种微生物对宿主的健康和疾病起着重要的作用。许多研究表明,微生物组中某些细菌数量的增加或减少可以缓解疾病。虽然关于微生物的变化是如何改善人类疾病的机制研究并不多,但这些内在机制的深入研究却非常重要。对这些已知信息的整理收集能够帮助我们更加全面了解肠道微生物的作用机制,有效推动微生物治疗的发展。基于此,我们构建了一个叫作GMAHD(the database of how Gut Microbes Affect Human Diseases)的数据库,收集归纳这些已知的机制信息。目前数据库共有121条记录涉及83种肠道微生物和34种疾病,该在线数据库可以通过http://cefg.uestc.cn/gmahd访问,所有的数据都可以免费下载且无需注册。肠道微生物能合成不同的代谢物,这些代谢物是潜在的候选药物,因此在GMAHD中,我们还增加了肠道微生物的代谢物信息。我们结合了HMDAD(http://www.cuilab.cn/hmdad)数据库的疾病与微生物关联信息,最终共有39种疾病被纳入我们的基于肠道微生物代谢物的疾病关联分析,这些信息均源自于已有的研究文献。在我们收集的文献中,39种疾病中共涉及96株肠道微生物,由于目前大部分肠道微生物是无法在体外培养的,我们是利用Magnusdottir等人构建的VMH(Virtual Metabolic Human)数据库中的微生物代谢物信息(https://www.vmh.life/该数据库包含了数百个人工构建的微生物代谢模型,这些模型是基于基因组、生化和生理数据组装而成的),并量化肠道微生物代谢物对人类疾病的影响,从而构建疾病关联,该疾病之间关系也由基于其他因素例如症状构建的疾病关联验证。此外,基于微生物代谢物与疾病之间的量化后的关系,我们对疾病进行聚类,聚到同一类的表明该疾病簇可能有相同致病机制,且可以用类似药用治疗。简言之,我们利用疾病关联分析并验证表明微生物代谢物的研究将有助于更深理解人类疾病并使得老药新用的开发有新的切入点。论证了肠道微生物代谢物在人类疾病研究中的重要影响,我们进一步提出简单的理论方法在众多代谢物中筛选潜在的有益代谢物及潜在药物并运用现有文献论证,此外我们还将其与疾病关联分析里的结果进行比较,由于时间等多方原因,该理论方法的结果还未有实验验证,因此后期还需要可靠大量的数据和体外实验来验证我们这个理论方法。