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本研究以柴达木绒山羊为研究对象,利用微卫星标记对8个位点进行遗传多样性分析;同时选取4个角蛋白辅助蛋白(KAP)基因,利用PCR-SSCP标记其作为候选基因选择绒细度和产绒量的可行性。选取的8个微卫星位点,均得到特异性扩增结果,共检测到59个等位基因,平均每个位点达7.375个。其中BM3413和LSCV24等位基因最多,各检测出9个;MAF-70和ILSTS082各检测出8个;BM3033检测出7个;LSCV13、BM1227和BM4037各检测出6个,所有的位点等位基因数皆大于或等于5。8个微卫星位点在柴达木绒山羊上均呈高度的多态性(PIC>0.5),位点LSCV24基因杂合度、有效等位基因和多态信息含量均最高(H =0.796,N=6.916, PIC=0.766);位点BM3413的基因杂合度、多态信息含量均最小(H=0.676,PIC=0.615);位点MAF-70的有效等位基因数最小(N=0.7672)。微卫星标记平均杂合度为0.733和平均多态信息含量为0.688,表明柴达木绒山羊遗传背景复杂,遗传多样性丰富。对4个KAP基因位点绒细度性状的标记效应进行F检验和多重比较,发现S3和S4两位点各基因型间的最小二乘均值差异不显著(P>0.05);S1位点AB基因型(LSM=15.852)显著高于AA和BB基因型(LSMBB =15.849,LSMAA=15.841)(P<0.05);S2位点AA基因型(LSM=16.003)显著高于AB和BB基因型(LSMAB=15.193,LSMBB=15.876)(P<0.05)。表明S1位点AB基因型和S2位点AA基因型可能为绒细度首选的标记基因型。对4个KAP基因位点绒重性状的标记效应进行F检验和多重比较,发现S1和S3两位点各基因型的最小二乘均值间差异均不显著(P>0.05);S2位点AB基因型(LSM=520.045)显著高于AA基因型(LSM=464.312)和BB基因型(LSM =433.136)(P<0.05);S4位点AA基因型(LSM=465.423)和BB基因型(LSM=461.365)显著高于AB基因型(LSM=433.082)(P<0.05)。表明S2位点AB基因型和S4位点AA,BB基因型可能为绒重性状首选的标记基因型。S1位点与绒细度的遗传相关(rBG=0.923437)、S2位点与绒重的遗传相关(rBG=0.968438)均最大;S2位点与绒细度的遗传相关(rBG=0.146687)、S4位点与绒细度的遗传相关最小(rBG=0.356966)均最小。表明S1位点可能为绒细度候选基因的主效基因,S2位点可能为绒重性状候选基因的主效基因。