政府主导型科技风险投资机构的运作离不开宏观经济形势、技术创新活动、金融证券市场、法律政策和人文环境等一系列宏观因素的制约.深圳在这些方面具有较好的条件,有利于风险投资机构的生存和发展.政府主导型风险投资机构的运作效率与其组织形式密切相关,在有限合伙制、公司制和信托基金制三种组织形式中,有限合伙制形式具有最佳的激励机制和约束机制,是风险投资机构的理想选择.受法律制度制约,有限合伙制现阶段在中国还无从实施,应在制度创新方面进行大胆探索.对现阶段政府主导型科技风险投资机构的运作模式进行改革.其基本思路是实行所有权和经营权的分离,委托经营;引入多种经济成分,官助民营;逐步扩大资金规模,稳健经营.在具体操作上可将政府主导型风险投资机构的风险资金分为种子资金和示范资金,种子资金为政策性资金,专门投资于高风险的、处于成长早期的高新技术项目;示范资金由商业性风险投资机构管理,发挥示范作用,带动风险投资发展.