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世代周期一直以来被认为是影响物种分子演化速度的关键因素之一而被人们所关注。在植物中,类似的研究主要集中在具有不同生活史的一年生植物和多年生植物中。由于基因组数据的缺乏,之前的研究只涉及少数的位点而得不到一致的结论。基于新近发布的5个模式植物的基因组数据,我们综合了85个管家基因,10个非管家基因家族及34个叶绿体基因的数据在全基因组范围来研究一年生植物与多年生植物分子演化速度的差异。 实验结果显示,在我们选取的基因中,73.9%-83.4%的核基因和71.4%-97.1%的叶绿体基因在一年生植物中有更高程度的核苷酸替代。这一趋势在同义替代位点和非同义替代位点都保持一致。符号检验和成对t检验都显著地拒绝演化速度一致的零假设而接受一年生植物演化速度快的备择假设。该研究的另一个发现是物种之间在非同义替代位点的替代速度都保持着比较好的相关性,而在同义替代位点由于物种之间大的演化距离导致同义替代的饱和而检测不到相关性。 根据我们的实验结果,一年生植物和多年生植物分子演化速度的差异是存在于核基因组及细胞器基因组的普遍现象,因此这种现象应归结于与植物一年生-多年生生活史相关的、全基因组范围的影响因素。这一现象支持世代周期假说。