为了确保高等教育品质，提升系所办学质量，台湾地区自2006年起就在高等教育评鉴中心的组织下开展了以五年为一周期的系所评鉴活动。其中，系所的自我评鉴是整个系所评鉴最为核心的环节。整个自我评鉴分为准备与设计阶段、组织阶段、执行阶段以及结果讨论阶段。系所需要根据评鉴中心给出的评鉴项目，对自身设定的教育目标、核心能力与课程设计、教师教学与学习评量、学生辅导与学习资源、学术与专业表现、毕业生表现与整体自我改善机制进行全面的检视，并且最终完成自我评鉴报告书。　　本研究选取屏东大学教行所进行个案研究，通过访谈法和文献法探究第二周期系所评鉴中，教行所开展自我评鉴的具体情况。通过研究发现，系所会成立工作小组分工完成各项评鉴项目。自我评鉴得以顺利实施的保障措施有法律法规的规范、对评鉴重点充分的宣传、校内各个行政单位的支持、参与人员的配合以及自我改善的落实等。自我评鉴体现了认可制精神，过程中第三方机构的干预较少，有助于自我评鉴机制的建立。　　本研究在总结自我评鉴优缺点的基础上，给大陆地区校内专业评估提出了相应的建议，分别是构建具体的专业培养目标、建立校内自我评估机制、增加第三方评估机构的审核以及建立校内资料库系统。