溪泥甲科(Elmidae)是昆虫纲水生鞘翅目的一个科，种类十分丰富，几乎全世界均有分布，目前世界范围内已知的有130个属1400个种，中国的溪泥甲科昆虫种类也相当丰富。溪泥甲的整个生活史基本都在水中，以藻类植物为食，对水质要求比较高，可以作为水质监测的理想指示物。如今，分子手段是研究昆虫分类的有力工具。但是，此技术在水生鞘翅目的研究中应用较少。特别是溪泥甲，由于个体差异大，分布广，采集困难，有关其发育关系和分类的研究极少，目前我国还没有开展分子实验。　　本实验利用2个核基因，4个线粒体基因对标本馆现有的溪泥甲科17个属49个种进行了分子系统学研究。通过DNA提取、PCR扩增、公司测序获得原始的分子矩阵，从GenBank数据库中下载了部分溪泥甲科的同源基因序列，得到最终的分子矩阵。　　将分子数据矩阵用不同的软件进行拼接、剪辑、模型计算、数据联合，最终利用核基因联合数据矩阵、线粒体基因联合数据矩阵以及全部基因联合数据矩阵分别建树，得到较为稳定的溪泥甲科系统发育关系树。主要结论如下:　　(1)有些属在系统发育树上为明显的单系群，如二叉溪泥甲属Cuspidevia，条带溪泥甲属Graphelmis，鹬溪泥甲属Grouvellinus等，这些属的分子学分类与传统形态学分类基本一致，分类地位十分明确。　　(2)有些属混杂在一起，如棘突溪泥甲属Paramacronychus、佐氏溪泥甲属Zaitzevia、平截溪泥甲属Urumaelmis，这些属的形态特征比较相似，传统形态学上的分类比较混乱，本文通过系统发育关系树，基于分子证据，认为这三个属应该并为一个属。　　本研究利用分子数据矩阵得到的演化关系树，对我国溪泥甲科部分属的系统发育关系进行了较全面的分析，并对有些属的分类地位重新进行了修订。