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本文首先回顾了国内外鱼类遗传育种的方法以及取得的成果，概述了杂交、三倍体育种、雌/雄核发育、转基因以及分子标记辅助育种在水产动物育种中的应用，同时对牙鲆的研究状况进行了综述，指出褐牙鲆(Paralichthysolivsceus)这一海洋名贵经济鱼类，在生活习性上为冷水性底栖鱼类，在水温23℃以上摄食减少，在水温达33℃时，成鱼只能短暂存活。厦门水域地处亚热带，牙鲆在高温季节的养殖受到显著影响，进行耐热品种的选育具有重要的现实意义。本文提出分子标记辅助选育方法有助于解决牙鲆在厦门乃至我国南方无法顺利度夏的难题。然后，围绕20对微卫星引物对牙鲆耐温池和非耐温池的筛选结果，对牙鲆亲鱼、子一代的生长、繁殖、抗逆性、生化组分、酶活性等进行研究，取得以下结果：
1)建立以自然度夏的牙鲆群体为耐温组，死亡的牙鲆为非耐组的基因池，应用20对微卫星引物对这两个基因池进行筛选，结果获得9个位点与耐温性间都存在一定的相关性，其中有3个位点与耐温性为负相关性，另外的6个位点与耐温性间存在正相关性。在9个位点中，Po42与耐温性为极显著的负相关，相关系数达到-0.408，P013的位点与耐温性为极显著的正相关，相关系数达到0.446，其余7个位点为一般显著性相关。
2)应用与耐温性为极显著的负相关的引物Po42对牙鲆的亲鱼进行筛选并精心培育，获得分子标记辅助选育的耐温牙鲆子一代。人工加温的条件下，耐温牙鲆子一代的成活率比非耐温牙鲆以及对照组都有显著提高。
3)对分子标记辅助选育的耐温组、非耐温组以及对照组的牙鲆进行生化成分分析，结果表明，在人工饲养初期3个组间蛋白质含量的区别不显著，当经历过高温期后，耐温组的牙鲆肌肉蛋白质含量有所增加，但非耐温组以及对照组的却降低。其它生化组分的变化没有显著的规律。
4)对分子标记辅助选育的耐温组、非耐温组以及对照组牙鲆的碱性磷酸酶、蛋白酶、过氧化氢歧化酶等的活性进行分析，结果表明除碱性磷酸酶在肝脏组织中3个实验组间有显著差异外，其它酶的活性基本相近。