肝细胞癌相关环状RNA的鉴定及其临床意义分析

来源 :宁波大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ycl12345
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目的:  在我国,肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是一种高发病率、低生存率的恶性肿瘤之一。大约70%的HCC患者发现时多处于中晚期,失去了外科手术、射频消融等根治性治疗的机会。因此,如何做到对 HCC的早发现、早诊断依旧是临床医生面临的难题。与其他肿瘤相似,基因的表达异常参与了 HCC的发生发展。近些年来,随着高通量测序方法的进步,非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA)在肿瘤发生发展中所发挥的作用吸引了越来越多医学研究者的青睐。最近,环状 RNA(circular RNA,circRNA)作为一种古老的ncRNA分子重新走入研究者们的视野,并且发现它们与肿瘤的发生、发展有着密不可分的联系,但是它们与 HCC之间的相关性研究甚少。因此,发现并鉴定与 HCC相关的circRNA对于我们提高对 HCC发病机制的认识将具有重要的现实意义。本研究拟先揭示 HCC相关 circRNA的表达谱,并在此基础上探索代表性 circRNA在HCC诊断中潜在的临床价值。  方法:  1.利用circRNA表达芯片,获得 HCC相关 circRNA表达谱。  2.收集63例 HCC患者的癌组织与对应的癌旁组织,42例慢性乙型肝炎患者肝组织标本。  3.生物信息学预测与 hsa_circ_0003570相互作用的微小 RNA(microRNA,miRNA)及信使RNA(message RNA,mRNA)分子。  4.应用实时定量逆转录-聚合酶链式反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测HCC组织、癌旁组织、肝硬化组织、慢性乙型肝炎组织及HCC细胞株中hsa_circ_0003570的水平,并以克隆测序技术证实hsa_circ_0003570的存在。  5.分析 hsa_circ_0003570表达水平与 HCC患者临床病理因素的相关性,揭示其可能的HCC诊断价值。  结果:  1.首次揭示了HCC相关circRNA表达谱,发现高达525种 circRNA在 HCC组织和癌旁组织中表达差异超过2倍,其中在 HCC组织中高表达和低表达的分别有173和352种。  2.经扩大标本量,采用qRT-PCR重点检测了代表性circRNA——hsa_circ_0003570与HCC的关系,发现hsa_circ_0003570在HCC组织中低表达;尤其重要的是,它在慢性乙型肝炎组织、肝硬化组织及HCC组织中的表达量呈阶段性递减表达特征。  3.进一步细胞水平研究发现,hsa_circ_0003570在正常肝细胞L02,非转移潜能HCC细胞株HepG2,低转移潜能HCC细胞株MHCC97L和SMMC-7721,高转移潜能HCC细胞株MHCC97H和HCCLM3中的表达水平呈显著性差异。  4.综合分析发现,hsa_circ_0003570通过基于miR-328、miR-185-3p、miR-138-5p和miR-342-5p等的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)影响HCC的发生发展进程。  5.为探讨 circRNA与 HCC的关系,还发现另外2种 circRNA与 HCC相关:hsa_circ_0005986与HCC的巴塞罗那分期标准(Barcelona clinic liver cancer staging system,BCLC)和转移相关;hsa_circ_0003258在癌组织中较癌旁组织明显低表达,与芯片结果一致。  结论:  本研究系统揭示了HCC相关circRNA表达谱;通过检测3种代表性的circRNA(hsa_circ_0003570、hsa_circ_0005986和 hsa_circ_0003258)在 H C C组织及细胞中的表达水平,说明它们在 HCC的发生发展过程中可能发挥作用,并且具有一定的诊断价值,有望成为一类新型 HCC标记物。鉴于 circRNA具有高稳定性的特性,这些新发现将会对 HCC的诊断和治疗提供新思路。
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