猪PNLIPRP2基因的克隆、原核表达、启动子调控及其与生产性状的关联分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gksd2009
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脂肪酶基因家族在脂类代谢和运输中起重要作用,和一些严重的疾病如肥胖,糖尿病和脂肪沉滞性动脉硬化症等相关联。胰脂肪酶相关蛋白2基因(pancreaticlipase-related protein 2,PNLIPRP2)属于脂肪酶基因家族。在人上的研究表明,PNLIPRP2参与肠内的脂解作用。同时在鼠上也发现PNLIPRP2对乳鼠日粮中的脂肪消化起重要作用。当日粮脂肪含量达到4%时,TH鼠(一种研究Ⅱ型糖尿病的模型动物)选择性地下调PNLIPRP2的表达量,导致脂肪沉积,体内的血糖增高。本研究将其做为影响猪脂肪沉积的一个候选基因,对其进行了克隆、表达谱、原核表达、启动子调控、多态性检测及其与生产性状的关联分析等研究。本研究为进一步探讨该基因对影响猪脂肪沉积的作用打下了基础,并为其将来应用于分子标记辅助选择育种奠定了分子遗传基础。主要研究结果如下:1.以人PNLIPRP2基因cDNA为探针,在NCBI的EST数据库中比对得到猪EST序列并进行拼接。根据拼接序列设计引物克隆出猪PNLIPRP2基因cDNA编码区全长序列。通过外显子设计引物扩增出了猪1、3、4内含子序列,内含子剪接位点序列符合GT-AG法则,同时通过生物信息学及比较基因组学的策略鉴定了该基因的其它内含子序列。将该基因的cDNA序列和DNA全长提交到GenBank,获得基因收录号EU715062和EU715063。利用CLUSTALW、TMprep、Signal P3.0、ProtParam等软件对所编码蛋白质的结构、功能等特征进行了预测和分析,并构建了系统进化树。2.半定量组织表达谱的研究发现,PNLIPRP2在二月龄大白猪小肠中表达量较高,在脑、脂肪中表达量较低,在骨髓、胃中表达量更低,在其它组织中几乎不表达。PNLIPRP2在四月龄大白猪小肠中表达量也很高,卵巢中的表达量次之,在其它组织中的表达量很低。3.在第3内含子93bp处发现了大白T/梅山C的碱基突变,并建立了PCR-Eco130Ⅰ-RFLP的检测方法。分析了在不同猪群中这个突变位点的多态性,计算了这个位点的基因型和基因频率,并发现各基因型在不同品种中的分布存在一定差异。对“大白×梅山”资源家系F2代223头个体的基因型与胴体性状和肉质性状进行关联分析,显示该突变位点与6-7腰椎间背膘厚、失水率、系水力和背最长肌色值有显著的相关(P<0.05)。4.构建了猪PNLIPRP2蛋白保守结构域的重组原核表达载体PGEX-KG-PLATPL,利用SDS-PAGE检测出该重组原核表达载体成功表达出了猪PLATPL蛋白。5.通过基因组PCR步移法从猪的基因组中扩增出了PNLIPRP2基因翻译起始位点上游3.7Kb的序列,并且运用NNPP、MethPrimer、TRANSFAC等生物信息学软件对猪PNLIPRP2基因的核心启动子、转录起始位点、CpG岛的分布以及与启动子相结合的转录因子进行了预测和分析。
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