论文是水权理论的一项基础性研究，由于干旱缺水己成为中国长期发展的瓶颈，这项研究具有重要的现实意义。研究理念有三个主要来源：张五常的“经济解释观”，诺思的“新经济史观”，黄仁宇的“大历史观”。研究方法遵循了制度经济学传统，大量利用了自然资源制度经济学、交易成本经济学、现代产权学派和企业理论的最新理论成果，提出了水权结构的描述模型和经济学理论，系统研究了中国过去两千年、五十年和五年的水权结构变迁。 论文有两个原始性学术创新：提出中国治水的科层结构观点，这一结构起源于两千年前秦的统一，在历史长河中伴随王朝更替延绵不绝，至今仍在世界范围内具有独特性；构建了水治理结构的选择模型，提出约束条件下交易成本最小化的结构选择逻辑，利用管理成本和合作成本解释了中国科层结构选择的内生性。上述两大创新丰富和发展了马克思—魏特夫—黄仁宇为代表的“治水派”学说，对于当代中国的水权理论研究有奠基性作用。 论文的其它重要学术创新包括：(1)修正并拓展了现代自然资源制度经济学的前沿理论，提出描述中国水权结构的科层概念模型；(2)系统提出了水权结构的经济学理论，阐明了水权的确切内涵；(3)首次在一个逻辑连贯的框架下，系统解释中国古代、现代和当代水权制度的变迁，揭示了水权初始分配的内在机制；(4)探讨了科层结构引入水市场的动力机制，以此剖析了当代水市场案例。 论文的主要结论有：(1)当代缺水危机的实质是国家管理成本付出不足导致的治理危机，反映了转型期集体行动面临的困境；(2)今后一段时期，行政手段在水资源分配中的作用还将继续强化，市场作用的拓展主要集中在供水市场，而不是水权市场；(3)由于维持科层治水结构的需求与国家治理科层结构的瓦解趋势相背离，现阶段中国应对水危机的唯一出路是大幅增加管理成本支付，这要求治水模式从工程建设为中心转向制度建设为中心。论文最后指出，中国当代治水面临的挑战本质上是对国家治理转型的挑战。