登革病毒EDIII蛋白的表达、纯化及其与ECV304细胞相互作用蛋白的筛选与鉴定研究

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登革病毒(dengue virus,DENV)是黄病毒属(Flaviviridae)有包膜的单股正链RNA病毒,有四个血清型(DENV-1~4),以蚊虫为媒介,广泛流行于热带和亚热带地区。DENV感染所致的人类登革热(classical dengue fever,DF)和登革出血热/登革休克综合征(denguehemorrhagic fever/dengue shock syndrome,DHF/DSS)严重危害人类健康。全球有25~30亿人生活在流行区内,每年有1亿以上的人遭受感染,DHF病例约50万,死亡率5~20%,如治疗不及时可达50%。近年来,随着全球气候变暖、人口流动、生态环境恶化、蚊媒分布区域扩展等诸多原因,登革热流行的范围和频率不断增加,WHO已将DHF/DSS、肝炎、疟疾、结核列为全球流行最严重的传染病。我国海南、广东、广西、福建、浙江和台湾等地区也都是重点流行区域,多次发生DF,DHF/DSS的爆发流行。但时至今日,对DENV感染性疾病尚无特异的治疗手段,也无安全有效的疫苗问世。因此,对DENV的致病机理展开深入研究,并从中发掘有效的治疗策略和途径是当前病毒学研究的当务之急。   DENV经蚊虫叮咬进入人体后,先在单核细胞系统(如树突状细胞,单核细胞等)和毛细血管内皮细胞(vascular endothelial cells,VECs)等靶细胞中增殖,经血流播散,引起疾病。血中高滴度的病毒可累及全身毛细血管内皮细胞,引起广泛微血管内皮功能障碍,血管通透性增加、出血和休克,介导DHF/DSS的发生。所以,人血管内皮细胞膜上必然存在着介导DENV感染的受体,但该受体迄今尚未阐明。因此,鉴定出血管内皮细胞膜上的DENV受体,对研究DENV的致病机理、研发受体特异性阻断剂等均具有非常重要的意义。   DENV受体的研究很早就受到重视,研究的方法也有很多,其中病毒铺覆蛋白印迹技术(Virus overlay protein binding assay,VOPBA)是较为“经典”的一种病毒受体筛选技术,该方法是以Western blot为基础,将细胞膜蛋白转印至PVDF膜上与病毒颗粒进行孵育,利用病毒颗粒与受体蛋白特异性结合的特点,分离病毒受体。VOPBA方法在鉴别病毒受体中虽应用广泛,但也有一定的局限性,如由于与转印膜孵育的是完整病毒颗粒,个头相对较大,与转印膜上的潜在受体蛋白结合不稳定,易造成漏筛,所以如果利用DENV与受体结合的关键结构域--包膜E蛋白DⅢ区代替完整病毒颗粒进行VOPBA将更有助于病毒受体的筛选。   本研究首先采用原核表达并纯化了DENV-2 E蛋白DⅢ区(EDⅢ)蛋白,用于代替全病毒颗粒建立改良的VOPBA技术,并以人血管内皮细胞来源的ECV304细胞系为靶细胞进行DENV相互作用蛋白的筛选工作,对筛选到的候选蛋白进行质谱分析、Westernblot实验等进一步验证筛选蛋白,再通过免疫共沉淀(Co-IP)实验和激光共聚焦显微技术明确筛选蛋白与DENV-2 EDⅢ[蛋白的相互关系及与病毒的共定位情况;最后,用生物信息学的方法模拟筛选蛋白与DENV-2 EDⅢ蛋白可能的结合方式和参与结合的残基,探讨筛选蛋白在DENV-2感染宿主细胞过程中的作用,为进一步揭示DENV的感染机制、研发受体特异性阻断剂奠定坚实的基础。   其研究内容和结果主要包括以下几个方面:   1.DENV-2 EDⅢ蛋白的原核表达、纯化及其抗体制备:①利用PCR从pV-DENV2-E质粒上扩增出EDⅢ基因;②通过酶切连接将EDⅢ基因亚克隆至原核表达载体pET22b+中,转化入大肠杆菌Rosetta(DE3)plysS;③对pET22b-EDⅢ/Rosetta工程菌进行表达,并对表达条件进行摸索,获得的工程菌表达产物经超声裂解后,EDⅢ蛋白质以包涵体的形式存在;④pET22b-EDⅢ/Rosetta工程菌表达得到的目的蛋白包涵体,经Ni-NTA亲和层析和阳离子交换层析两步纯化后,获得纯度达98%以上的目标蛋白,并对蛋白进行Western blot鉴定;⑤将纯化好的目的蛋白经透析法复性,并采用改良Lowry法进行蛋白质定量后,冻存备用;⑥为获得目的蛋白抗体,将目的蛋白分别免疫Balb/c和C57BL/6小鼠,得到相应抗体后加等体积甘油冻存备用。   2.改良VOPBA方法筛选ECV304细胞上DENV相互作用蛋白:①利用差速离心的方法提取人血管内皮ECV304细胞各组分蛋白;②用纯化的DENV-2 EDⅢ蛋白代替全病毒颗粒,建立了改良的VOPBA技术,并成功在ECV304细胞膜蛋白提取物中筛选到34,43和55 kDa三个蛋白能与EDⅢ蛋白相互作用,质谱分析显示筛选到的43 kDa蛋白为微丝(fibrous-actin,F-actin),55 kDa蛋白为波形蛋白(vimentin);③制备43 kDa蛋白小鼠抗血清进行阻断改良VOPBA实验和Western blot实验,进一步证实选到的43kDa蛋白为actin;④利用Co-IP实验体外验证actin与DENV-2 EDⅢ蛋白相互作用,提示DENV可能是通过包膜E蛋白Ⅲ区这样功能结构域结合actin的。   3.43 kDa actin蛋白在DENV感染过程中的作用:①激光共聚焦显微技术观察DENV-2感染不同时相点的人血管内皮ECV304细胞中微丝骨架的形态变化,感染第5min时,细胞微丝出现了解聚,较多的短F-actin积聚形成团块,从感染的第35 mim~1h,部分应力纤维束开始恢复,主要分布在细胞膜下的皮质区,感染24 h后,由于病毒的大量复制、病毒蛋白的堆积,又能再次引起F-actin的解聚以及应力纤维的消失,这提示我们DENV是通过改变actin来进入细胞的;②利用免疫荧光双染色进一步观察感染24,48和96 h的ECV304细胞actin与DENV-2 E蛋白的细胞定位情况,发现actin与E蛋白有明显的随感染时间逐渐增强的共存,提示除了进入之外,actin可能参与了DENV-2颗粒在细胞内的运输等其它感染过程。   4.F-actin结合DENV-2 EDⅢ的方式及结合残基的预测:①从PDB蛋白晶体结构数据库下载天然结构的F-actin和可溶性的DENV-2 EDⅢ蛋白结构,采用ZDOCK软件将结构数据传输到浪潮天梭高性能服务器集群完成对actin和EDⅢ蛋白的分子对接,根据得分情况获得5个最佳结合的复合物结构;②采用KFC2软件对这5个复合物进行了结合残基的预测,分析了F-actin和EDⅢ蛋白结构中最可能发生相互结合的残基位点。   综上所述,本研究用纯化的DENV-2 EDⅢ蛋白代替全病毒颗粒,建立了改良VOPBA技术筛选人血管内皮细胞登革病毒相互作用蛋白,却意外发现作为细胞骨架的actin在DENV-2的整个感染过程中都起了非常重要的作用,参与病毒的进入、胞内运输及释放等过程。由于actin与EDⅢ蛋白在体外能发生相互作用,并与E蛋白在体内有随感染时间逐渐增强的共存,提示EDⅢ蛋白可能是病毒与actin相互作用的重要组分,并且我们利用生物信息学软件对actin与DENV-2 EDⅢ蛋白可能的结合方式和结合残基进行了预测。这一实验结果为后续设计蛋白突变体深入研究两者相互关系,揭示DENV的感染机制提供了重要的实验依据。当然,DENV与actin相互作用的机制以及其中所涉及的信号调控通路还有待于深入研究。
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