α-突触核蛋白(SNCA)基因多太性与帕金森病易感性的meta分析

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目的:  帕金森病是中老年人常见的神经系统性变疾病,其临床特征以静止性震颤、动作迟缓、僵直和姿势不稳为常见,使患者生活质量大大降低,而其病因迄今尚未明确,这给病人和家庭乃至社会带来了巨大的负担。据报道,α-突触核蛋白(SNCA)的单核苷酸多态性(SNPs)与帕金森病(PD)相关。α-突触核蛋白是一种中枢神经系统突触前表达的可溶性蛋白质,它的异常聚集被认为是疾病发病的分子机制中一个关键的步骤。目前的证据表明,α-突触核蛋白的遗传变异在帕金森病的病因学中起着重要的作用。一些研究试图在各种族人群中验证这一关联,但有些研究结果表明SNCA的基因多态性与帕金森病有关联,而另外一些研究结果表明二者无关联。为了进一步验证这些单核苷酸多态性和帕金森病之间的关系,作者进行了一系列的荟萃分析。  方法:  1、确定检索策略和收集文献。检索PubMed、MEDLINE和PD gene数据库来确定相关的文献。以(“Parkinsons disease,”“Parkinsonsdisease,”“Parkinson disease,”“PD”,)、(“Alpha-synuclein”,“α-synuclein”,“SNCA”)和(“variant”,“mutation”,“polymorphism,”“genetics”和“SNP”或者“single nucleotidepolymorphism”)为检索式。  2、确定纳入和排除标准。纳入标准为:1)病例对照研究设计;2)明确定义病例人群和对照人群;3)可以获得病例人群和对照人群基因型分布的数据;4)全部/部分数据关于SNCA基因多态性;5)每个基因多态性至少包含四个提供数据的研究;6)对照人群基因型的分布符合哈迪温伯格平衡。排除标准为:1)案例报告;2)以家族为基础的设计;3)原文中没有基因型原始数据或联系作者后仍无法获得原始数据来计算风险。  3、提取数据。从每篇研究中提取以下信息:第一作者名称,出版年份,人群所属国家,人种,病例组和对照组的人数,基因分型方法和基因型分布。  4、统计学处理。用stata11.0软件进行Meta分析。分别计算三种基因包括显性模型,隐形模型,纯合子模型的OR值及95%CI。根据异质性检验结果选择模型。  结果:  1、文献检索结果:通过以上检索式检索,共检索到349篇文献,根据纳入和排除标准剔除了330篇文献,Meta分析中共引用了19篇关于SNCA10个SNP的文献:rs181489,rs356186,rs356219,rs894278,rs2583988, rs2619363, rs2619364, rs2737029, rs10005233和rs11931074。  2、Meta分析结果:rs181489三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.273(1.133,1.429),1.572(1.373,1.801)和1.678(1.455,1.934);rs356186三种模型的OR值及95%可信区间分别为0.747(0.658,0.848),0.715(0.513,0.997)和0.653(0.466,0.913); rs356219三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.255(1.136,1.385),1.381(1.192,1.600)和1.523(1.282,1.808);rs894278三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.272(1.174,1.377),1.341(1.208,1.488)和1.493(1.331,1.675);rs2583988三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.275(1.186,1.371),1.289(1.133,1.466)和1.409(1.233,1.609); rs2619364三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.136(0.999,1.292),1.303(1.042,1.630)和1.346(1.068,1.696); rs10005233三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.359(1.134,1.630),0.862(0.707,1.052)和0.855(0.675,1.084);rs11931074三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.419(1.300,1.548),1.487(1.361,1.626)和1.798(1.572,2.057); rs2619363三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.088(0.935,1.266),1.216(0.938,1.576)和1.250(0.956,1.634); rs2737029三种模型的OR值及95%可信区间分别为1.193(0.878,1.622),1.274(0.974,1.665)和1.355(0.898,2.044)。  结论:  这10个候选SNPs中的8个可能与帕金森病有关。帕金森病和以下SNPs被发现有显著相关性:rs181489,rs356186,rs356219,rs894278,rs2583988,rs2619364,rs10005233和rs11931074。在这些SNPs中,发现rs356186是唯一可能在帕金森病中发挥保护作用的SNP。这些结果表明,SNCA基因多态性与帕金森病易感性有关。
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