欧蓍草花粉过敏原Par j1蛋白与突变体的表达鉴定及生物信息学分析

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近十几年来,随着工业化、城市化进程的推进,变态反应性疾病的发病率逐年增加。花粉作为一种常见吸入性过敏原,导致的过敏性疾病已严重影响人类健康。欧蓍草(Parietaria judaica)目前在我国及欧洲地中海等各地栽培,种植广泛。然而研究发现欧蓍草花粉在夏秋季节飘逸广泛,是导致过敏性疾病的重要原因,因此对该花粉中主要过敏原基因重组表达及突变有着重要的理论与实际意义。  本研究通过对欧蓍草花粉主要过敏原Parj1重组表达并进行突变及纯化鉴定,同时采用生物信息学对该蛋白的理化性质,进行预测分析,为国内欧蓍草花粉的研究奠定一定的理论参考,并为临床上欧蓍草花粉过敏诊断及特异性免疫治疗奠定基础。主要工作如下:  (1)密码子优化的Parj1融合蛋白的表达纯化及鉴定  根据Parj1.0102在GenBank中的序列号(O04404)获得其核苷酸和氨基酸序列,确定开放阅读框,采用DNAstar软件优化密码子,合成全基因,为方便后续纯化,在目的基因C端加上strepⅡtag,构建表达载体pET44a/Parj1.0102,转化表达宿主大肠杆菌Rosetta,IPTG诱导表达,优化蛋白表达条件并进行亲和层析纯化和Western blot鉴定;最终确定在30℃,IPTG浓度为1.0mmol/L,诱导4h时蛋白表达量最高,重组蛋白经亲和层析纯化,SDS-PAGE分析纯化产物在23kD处有明显的条带。Western blot表明重组蛋白具有与StrepⅡ标签抗体结合活性。  (2)Parj1融合蛋白突变体的表达纯化及鉴定  通过在线数据库NetMHCII2.2对Parj1蛋白进行MHC-Ⅱ抗原表位分析,将高抗原表位值降低,经分析将第23位氨基酸T定点突变为W,设计突变引物,根据突变试剂盒说明,对含有目的基因的pET44a/Parj1.0102质粒进行突变,用突变成功的质粒转化感受态细胞,对培养的细菌进行测序鉴定,将测序正确的突变质粒,转化表达宿主大肠杆菌Rosetta,IPTG诱导表达,Western blot及亲和层析纯化在23kD处得到明显单一条带,成功表达Parj1蛋白突变体。  (3)Parj1蛋白生物信息学分析  应用DNAstar软件的Editseq和Gene Quest程序对Palj1进行密码子优化;应用DNAstar软件的Protean程序预测分析蛋白质理化性质;应用expasy数据库的swiss-modle程序对蛋白质三维结构预测分析;采用NetMHCII2.2在线数据库预测分析MHC-Ⅱ类细胞抗原表位,通过以上对该蛋白的生物信息学分析,为欧蓍草Parj1蛋白的进一步研究奠定理论基础。
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