中国板栗(Castanea mollissima)在世界栗属植物的起源、系统进化以及品种改良中占有重要的地位。本文采用微卫星分子标记，从大尺度地理格局对中国板栗自然居群的遗传多样性和遗传结构进行了分析，结果表明中国板栗自然居群具有丰富的微卫星遗传多样性，且遗传变异主要存在于居群内；华中地区的中国板栗自然居群的遗传多样性最高，其次为西北地区和华东地区，而西南地区遗传多样性最低，在综合前人研究的基础上，推测神农架及其周边地区为现代中国板栗的遗传多样性中心；基因流—漂变平衡检测结果表明基因流模型对居群历史产生了影响，然而大部分居群间的遗传分化均为显著，暗示中国板栗自然居群间可能存在适应性分化，自然选择作用对中国板栗群体遗传分化的影响可能比基因流作用的影响更明显；遗传距离与地理距离之间无显著相关性：UPGMA聚类分析结果与其地理分布格局并不吻合，说明不同地理区域的中国板栗自然居群间在遗传上并没有明显的界限，对中国板栗生态区的划分缺乏分子证据。研究结果所揭示的居群遗传信息为制定中国板栗野生资源合理的保育策略提供了科学依据。