唇腭裂易感位点和microRNA多态性与非综合征型先天缺牙易感性的关联研究

来源 :南京医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:smalleye
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第一部分唇腭裂易感位点与非综合征型先天缺牙易感性的关联研究目的:非综合征型先天缺牙(Non-syndromic tooth agenesis,NSTA)与非综合征型唇腭裂(Non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的发生是颌面部常见的两种发育畸形,其二者可能存在着共同的遗传致病因素。基因多态性即单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)在人类基因组中广泛存在,与个体多种疾病的遗传易感性存在关联。我们既往一项全基因组关联研究(Genome-wide association study,GWAS)发现了5个NSCL/P易感位点,基于NSCL/P与NSTA可能存在的共同遗传致病途径,本研究通过一项病例-对照研究以探究该5个NSCL/P易感位点是否与NSTA易感性存在关联。材料与方法:该病例-对照研究纳入677个NSTA病例与1144名健康对照,使用TaqMan探针基因分型技术对五个NSCL/P易感位点(rs2235371,rs7078160,rs8049367,rs4791774和rs13041247)进行基因分型,使用SPSS和PLINK软件进行统计分析。结果:在总体关联分析以及根据缺失牙数目进行的分层分析中,五个NSCL/P易感位点的等位基因频率、基因型分布在病例和对照组中无差异。然而在根据不同缺失牙类型进行的分层分析中,rs8049367与下颌前磨牙的缺失存在关联(显性模型中OR=0.66,95%CI=0.47-0.93,P=0.016;杂合模型中OR=0.60,95%CI=0.41-0.88,P=0.008);rs4791774与上颌尖牙(显性模型中OR=0.53,95%CI=0.28-0.98,P=0.041;杂合模型中OR=0.50,95%CI=0.26-0.97,P=0.041)和上颌前磨牙的缺失有关(相加模型中,OR=0.59,95%CI=0.36-0.96,P=0.035)。结论:本研究结果发现NSCL/P易感位点rs8049367和rs4791774可能和NSTA易感性存在关联。第二部分micro RNA多态性与非综合征型先天缺牙易感性的关联研究背景:非综合征型先天缺牙(Non-syndromic tooth agenesis,NSTA)是最常见的牙齿发育异常之一。微小RNA(Micro RNA,mi RNA)参与了颅面部及牙齿的发育过程,因此,mi RNA的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)可能会与NSTA发病风险存在关联。材料与方法:本病例-对照研究纳入677名NSTA患者和1144名健康对照,对四个mi RNA上的SNPs位点(mi RNA-146a rs2910164,mi RNA-196a2 rs11614913,mi RNA-605 rs2043556,mi RNA-618 rs2682818)通过Taq Man探针进行基因分型。使用PLINK1.07软件进行统计分析,评估该四个SNPs与NSTA易感性之间的关联。结果:在总体关联分析中,发现mi RNA-605 rs2043556可使罹患NSTA的风险增加到1.49倍(纯合子模型:P=0.031,OR=1.49,95%CI=1.04-2.13)。在按照缺失牙数目及缺牙类型进行的分层分析中,rs2043556与少数牙缺失(缺牙数目小于6颗)发病风险存在关联(纯合子模型:P=0.034,OR=1.48,95%CI=1.03-2.13);同时与上颌侧切牙(纯合子模型:P=0.023,OR=2.09,95%CI=1.11-3.94)、上尖牙(相加模型:P=0.007,OR=1.69,95%CI=1.16-2.47)和下尖牙(相加模型:P=0.044,OR=1.21,95%CI=1.01-1.45)缺失有关。mi RNA-146a rs2910164与上颌中切牙(相加模型:P=0.014,OR=2.49,95%CI=1.21-5.15),上颌磨牙(隐性模型:P=0.018,OR=4.04,95%CI=1.27-12.89)和下颌前磨牙缺失(杂合子模型:P=0.039,OR=0.68,95%CI=0.47-0.98)的发生有关。结论:本研究表明mi RNA-605 rs2043556和mi RNA-146a rs2910164多态性与非综合征性先天缺牙的发病风险相关。
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