蛇类肝脏中胆酸盐输出泵BSEP的初步鉴定研究

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目的:蛇胆是常用中药。本文对蛇肝脏中主要负责胆汁酸分泌的转运蛋白-胆酸盐输出泵(BSEP)展开相关文献和实验研究,从基因水平和蛋白水平分别对BSEP进行初步鉴定,为蛇胆汁代谢调控的进一步研究奠定基础。方法:在基因水平,以经计算机生物信息学分析推测的眼镜王蛇、剑纹带蛇、缅甸王蛇BSEP的编码基因ABCB11的部分序列信息为基准,设计特异性识别ABCB11的引物,对聚合酶链式反应产物进行同源性对比分析,鉴定蛇肝脏中BSEP;以上述测序序列为基础,采用3′RACE及5′RACE技术(DNA末端快速扩增)获得大王蛇ABCB11基因全序列;在蛋白质水平,采用纳升级毛细管反相液相色谱串联质谱(RPLC-MS/MS)将蛇肝脏总蛋白分成15个组分的混合肽段,洗脱后直接进入triple-TOF对离子信息进行分析,搜索眼镜王蛇的蛋白组数据,进行蛋白质组学分析。结果:通过聚合酶链式反应并结合同源性分析,得到了ABCB11的4段序列信息。采用3′RACE技术获得大王蛇肝脏中ABCB11的3′端未知序列,并与上述四段序列拼接到一起(共2666bp),拼接序列与三种蛇推测的ABCB11同源性极高;而5′RACE未达到理想结果,仍需进一步改进。RPLC-MS/MS分析蛇肝脏蛋白组,得到置信度≥95%的11段BSEP的肽段信息,蛋白排位336,假阳性率FDR为1%,鉴定关键参数unused protscore为22.56,结果显示了蛋白存在的准确性。结论:在基因水平和蛋白水平均证明蛇类肝脏中存在负责分泌胆汁酸的主要转运体-胆酸盐输出泵(BSEP),为进一步研究该蛋白的结构与功能及蛇胆汁酸的代谢调控奠定了基础。
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