转录组学和代谢组学整合策略用于刺五加干预慢性不可预测性温和应激小鼠的机制研究

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目的:采用慢性不可预测性温和应激(CUMS)诱导小鼠抑郁模型,运用转录组学和代谢组学整合策略,研究中药刺五加(ASH)对CUMS模型小鼠大脑前额叶皮层内基因表达和代谢物的的影响。通过研究差异共表达基因的生物信息和代谢物参与的生物代谢通路,并结合胰岛素抵抗和炎症反应相关指标,阐明ASH治疗抑郁症作用机制。方法:(1)首先进行糖水偏好测试筛选实验用雄性ICR小鼠,随后按照体重和糖水偏好率将小鼠分为正常组(N,n=10)、模型组(M,n=10)、ASH三个药物干预组(HD,400 mg/kg,n=10;MD,200 mg/kg,n=11;LD,100mg/kg,n=10)和阳性药氟西汀组(PD,10 mg/kg,n=10)。实验期间,每周记录小鼠的体重和摄食量。CUMS造模进行6周后,进行行为学评估、葡萄糖耐受性测试(OGTT)以及血清炎症因子和胰岛素检测,从药效学的角度初步考查ASH对CUMS模型小鼠的干预作用。(2)运用RNA-seq转录组学技术对N组、M组、ASH最佳剂量(MD)组前额叶皮层基因进行差异表达分析。对筛选后的差异表达基因,分别进行GO、KEGG和蛋白互作网络等生物信息学注释分析。(3)通过GC-MS代谢组学技术检测小鼠前额叶皮层代谢物,采用多维统计方法分析M组与其他5组小鼠前额叶皮层的差异性物质,搜索NIST 05数据库、HMDB和KEGG数据库获得差异代谢物的信息,结合Metaboanalyst 4.0在线综合分析平台,获得代谢通路。结果:(1)与N组小鼠相比,从第4周开始,M组小鼠的体重和摄食量开始显著降低(P<0.05);在第6周的糖水偏好实验中,M组小鼠表现出降低的糖水偏好(P<0.05)。随后,在强迫游泳和悬尾实验中,M组小鼠的静止不动时间增加(P<0.05,P<0.001),在敞箱实验中,M组小鼠的行为学得分降低(P<0.01)表明M组小鼠出现抑郁样行为。在高架十字迷宫中,M组小鼠进入开放臂的频率和开放臂所待时间百分比均减少(P<0.05),出现焦虑症状。血清生化指标检测结果表明:M组小鼠出现高空腹胰岛素水平(P<0.01)、肿瘤坏血因子-α和白介素-6水平(P<0.05)。药效学研究结果表明,ASH各剂量组显著增加由CUMS诱导的体重降低、摄食量减少,并且改善CUMS模型小鼠的抑郁和焦虑样行为、胰岛素抵抗和炎症反应。其中刺五加中剂量疗效较好,较稳定。(2)RNA-seq测序结果表明,CUMS造模改变了部分基因的表达水平,而ASH干预逆转了其中14个基因的表达(P<0.05,且Fold Change(FC)值>1.2或<0.83)。这14基因参与生物学过程(BP),如:细胞内过程类别、单个组织过程类别和生物调控类别;构成细胞组成部分(CC),如:细胞相关组分类别和细胞器组分;具有绑定分子类别和催化活性类别的分子功能(MF)。KEGG通路富集分析结果表明:能量相关的代谢通路如:甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解、β-丙氨酸代谢和磷酸戊糖途径被显著富集。进一步的研究发现:少突胶质细胞特异性蛋白基因(Opalin)和血红蛋白相关基因(Hba-a1,Hbb-bs和Alas2)在应激诱导的抑郁症中起重要作用;Retsat和Plin4基因表达异常与CUMS引起的胰岛素抵抗现象密切相关;而Hibch和Etnppl基因的表达异常可能会诱导CUMS模型小鼠出现代谢紊乱。(3)代谢组学研究中通过多维统计分析发现N组与M组小鼠在前额叶皮层中存在代谢差异。随后通过OPLS-DA分析,筛选并鉴定出24个代谢物(VIP>1,且P<0.05)。这些代谢物主要参与(a)氨酰t RNA生物合成,(b)丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,(c)甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,(d)柠檬酸循环(TCA循环),(e)缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成,(f)泛酸盐和辅酶A生物合成和(g)泛醌和其他萜类醌生物合成,这7条代谢通路。刺五加HD组、MD组和LD组分别逆转了11种、13种、15种差异代谢物的变化。热图聚类分析结果表明MD组对上述24个差异代谢物的改善效果最接近阳性药-氟西汀。氟西汀逆转了14个代谢物的变化,其中,L-天冬氨酸参与的丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢是阳性药特异性改善通路。结论:(1)ASH具有抗抑郁作用,其作用机制与改善CUMS小鼠的胰岛素抵抗现象和抗炎症反应密切相关。(2)RNA-seq转录组学分析表明ASH可以改善由CUMS诱导的应激小鼠前额叶皮层基因表达异常。其中少突胶质细胞特异性蛋白基因(Opalin)、血红蛋白的合成(Hba-a1,Hbb-bs和Alas2),胰岛素抵抗(Retsat和Plin4)和大脑前额叶皮层代谢紊乱(Hibch和Etnppl)相关基因可能参与抑郁症的发展。(3)代谢组学分析结果表明与N组相比,M组小鼠前额叶皮层中确实出现了代谢紊乱,而ASH可以改善由CUMS诱导的小鼠前额叶皮层代谢异常。
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