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目的：了解湖南省长沙市与郴州市基层医院3种慢性病一般基本情况,分析其住院相关费用的影响因素。方法：采用横断面研究方法对湖南长沙市与郴州市二级基层医疗机构的住院病人病例采集有关住院费用资料。利用EPIDATA3.02软件包进行数据录入,应用SPSS17.0软件包进行数据处理和分析,用均数、中位数和频率进行统计描述；采用非参数检验、方差分析对住院费用的影响因素的单变量分析,采用多重线性回归分析进行患者住院费用的多因素分析。结果：共采集郴州市和长沙市基层医疗单位116名高血压、109名冠心病、117名2型糖尿病共342名慢性病患者患者病例,结果显示其中51.8%为女性,患者中小学文化程度所占的比例最大(31.3%),医疗制度中以城镇职工医保和新农合的患者较多(两者的比例超过70%),农业劳动者居多,已婚人数最多,患者年龄平均64.3岁,住院天数平均为12.2天,住院总费用中位数为3286元,均值为4681元,其中检查费用均值为287元,化验费用均值为503元,西药费均值是1917元；高血压、冠心病和2型糖尿病的次均总费用中位数分别为：2858元,3550元和3475元,以冠心病的总住院费用为最高；西药费是住院总费用的主要组成部分,占总住院费用的40.96%；多元线性回归分析显示住院天数、医疗制度支付方式、年龄是影响住院总费用的主要因素。结论：慢性病患者次均住院总费用均值为4681元,高于2009年全国县级市属医院总住院费用平均水平(4381元)；以冠心病的总住院费用为最高；西药费是住院总费用的主要组成部分,占总住院费用的40.96%；住院天数、医疗制度支付方式、年龄是影响住院总费用的主要因素,减少住院日是控制慢性病住院费用增长的重要措施。