【摘 要】
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目的:斑点热群立克次体(Spotted fever group rickettsia,SFGR)是一种专性细胞内寄生的革兰阴性杆菌,该病原体通过蜱进行水平和垂直传播,在世界范围内广泛分布并引起严重的卫生学
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目的:斑点热群立克次体(Spotted fever group rickettsia,SFGR)是一种专性细胞内寄生的革兰阴性杆菌,该病原体通过蜱进行水平和垂直传播,在世界范围内广泛分布并引起严重的卫生学问题。本次研究的目的是建立一种检测斑点热群立克次体的荧光定量PCR方法,并对该方法进行评价。
方法:通过比对GenBank上14种常见的斑点热群立克次体ompA序列,选择保守区域设计引物和探针。通过PCR扩增目的片段,提纯后进行克隆转化,以构建标准质粒。倍比稀释标准质粒用于荧光定量PCR检测,确定该方法的检测下限。用real-time PCR扩增若干种斑点热群立克次体、立克次体目内其他种属的菌株和非立克次体病原体DNA,确定该方法的特异性。从云南省采集265份动物全血样本,通过离心分离血清。运用间接免疫荧光(IFA)作为金标准检测265份动物血清样本。运用DNA提取试剂盒从血凝块中提取DNA,用于荧光定量PCR的检测。通过logistic回归绘制ROC曲线并以其中约登指数最大者作为real-time的最佳诊断阈值。比较间接免疫荧光和荧光定量PCR的检测结果,确定real-time PCR的灵敏度和特异度。
结果:通过对标准品的测定,明确该方法的检测下限为102 copies/μL。该方法能够特异性的扩增除小株立克次体外所有斑点热群立克次体实验菌株的DNA,包括西伯利亚立克次体,康氏立克次体,弗诺立克次体,立氏立克次体,非洲立克次体,派氏立克次体,加拿大立克次体,黑龙江立克次体。立克次体目内其他菌株和非立克次体病原体DNA均为产生扩增信号。265份血清样本中,有76份(28.68%)IFA检测阳性。ROC曲线下面积和95%置信区间为0.89(0.84,0.93)。Real-time PCR的最佳诊断阈值为Ct<36.17,在该阈值下灵敏度为93.42%,特异度为93.12%。一致性检验,kappa值及95%CI为0.84(0.77,0.91)。
结论:荧光定量PCR用于斑点热群立克次体的检测,具有较高的灵敏度、特异度和稳定性,因此可用于SFGR的流行病学和临床研究以及疾病的早期诊断。
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