简单重复序列(SSR)是进行遗传多样性研究的一种有效分子标记,目前尚未见到用SSR对中国小麦种质资源进行遗传多样性研究的报道.该研究选用中国小麦的部分主要栽培品种、地方品种、国外引进品种及中国特有的三个小麦亚种,共109份材料,采用SSR分子标记技术,利用聚类分析手段,对供试材料进行了遗传多样性研究,取得了以下主要结果:一、SSR检测的遗传多样性比较高,36个位点上共检测到234个等位变异,平均每个位点的等位变异数目为6.7,大多数SSR检测位点的多态性集中在5-8个等位变异,等位变异最多的两个位点wms155,wms186可检测到12个等位变异;二、在72份普通小麦中共检测到30个品种等位变异,其中10个存在于中国地方品种中,说明地方品种是丰富小麦遗传多样性的主要资源;三、对72份普通小麦进行聚类,发现各品种间的相似系数很高,集中在0.65-0.85之间,72份普通小麦聚为16组,系谱相同或相似的材料有的聚为一组,有的并没有聚为一组,且相似系数相差很远;四、对包括中国特有品种在内的87份材料进行聚类,发现几份供试的西藏半野生小麦并没有聚为一组,说明就整个基因组而言,西藏半野生小麦与普通小麦之间的差异并不明显,它们的差异只存在于个别染色体上.