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本文通过对分布于我国境内12个不同地理种群的中华稻蝗(Oxya.Chinensis)和日本稻蝗(Oxya.Japonica)共46个个体的线粒体基因COII和核基因ITS区域(包括ITS1，5.8S，ITS2)进行核苷酸序列分析。结果表明：这两个基因的编码区段进化速率较快，比较适合用于种群遗传分化的研究。同时，由于ITS区域的核苷酸突变率更高，ITS区域比COII基因更适合于做为稻蝗属种群遗传的分化标记。
以小稻蝗(Oxya.Hyla)为外群，基于COII基因和ITS片段的序列，运用邻接法和最大似然法两种方法构建不同种群系统进化树，结合Genebank中提供的其他种相关信息，分析了稻蝗不同地理种群之间的遗传分化和相关近缘种的系统发育关系，并利用bootstrap对分析结果进行了置信度检验。结果表明：江家镇地区的稻蝗与其他地理种群遗传距离较远，天堂寨种群与其它中华稻蝗种群之间的遗传距离相对较远；中华稻蝗(O.Chinensis)各地理种群之间的遗传距离相对较大，日本稻蝗各地种群之间的遗传距离相对较小，中华稻蝗与日本稻蝗之间具有较近的亲缘关系。同时发现，种群之间的遗传受地理环境因子的影响较大。结合其它方面的数据。通过COII基因分析，草绿蝗(Parapleurus alliaceus)很可能属于稻蝗的近源种。通过ITS区域分析，安徽天堂寨的中华稻蝗可能是小稻蝗(O.podisma)。